๐ฉบ 3D Slicer๋ก ๋๋ด๋ PET ์์ ๋ถ์: ๊ธฐ์ด๋ถํฐ SUV ๊ณ์ฐ๊น์ง ์๋ฒฝ ๊ฐ์ด๋[ge]
๐ฉบ 3D Slicer๋ก ๋๋ด๋ PET ์์ ๋ถ์: ๊ธฐ์ด๋ถํฐ SUV ๊ณ์ฐ๊น์ง ์๋ฒฝ ๊ฐ์ด๋
๐ ๋ชฉ์ฐจ
3D Slicer๋? ํ์ ๋ฐฐ๊ฒฝ๊ณผ ๋ชฉ์
3D Slicer๋ง์ด ๊ฐ์ง ์๋์ ์ธ ๊ฐ์
PET ์์ ๋ถ์์ ํต์ฌ: SUV๊ฐ ๋ฌด์์ธ๊ฐ?
[์ค์ ] PET ์์ ๋ถ์์ ์ํ ๋จ๊ณ๋ณ ์คํ ์ ์ฐจ
๊ฐ์ฅ ๋น ๋ฅด๊ฒ 3D Slicer ์ ๋ณตํ๋ ๋ฒ
[ํฌ์ ์ธ์ฌ์ดํธ] ์๋ฃ AI ๋ฐ ์์ ์ง๋จ ๊ด๋ จ์ฃผ
์์ฝ ๋ฐ ์ฐธ๊ณ ๋ฌธํ
1. 3D Slicer๋? ๋๊ฐ, ์ ๋ง๋ค์์๊น?
3D Slicer๋ ๋จ์ํ ์์์ ๋ณด๋ ํ๋ก๊ทธ๋จ์ด ์๋, ๊ฐ๋ ฅํ ์๋ฃ ์์ ์ปดํจํ ํ๋ซํผ์ ๋๋ค.
๋๊ฐ ๋ง๋ค์๋?: ํ๋ฒ๋ ์๋ ๋ธ๋ฆฌ๊ฒ ์ฌ์ฑ ๋ณ์(BWH), MIT AI ์ฐ๊ตฌ์ ๋ฑ ์ธ๊ณ์ ์ธ ๊ธฐ๊ด๋ค์ด ํ๋ ฅํ์ฌ ํ์์ํจ ์คํ์์ค ํ๋ก์ ํธ์ ๋๋ค.
๊ฐ๋ฐ ๋ชฉ์ : ์ฐ๊ตฌ์๋ค์ด ์๋ฃ ์์ ๋ฐ์ดํฐ๋ฅผ ์๊ฐํํ๊ณ , ๋ถ์ํ๋ฉฐ, ๋์๊ฐ **์์ ์ ๋ ์น๋ฃ(Image-guided therapy)**์ ํ์ฉํ ์ ์๋ ์์ ๋ก์ด ํ๊ฒฝ์ ์ ๊ณตํ๊ธฐ ์ํจ์ ๋๋ค.
2. 3D Slicer์ ํ์ด๊ธฐ! ๊ฐ์ฅ ์ํ๋ ์์ ์?
์ด ํ๋ก๊ทธ๋จ์ ๋ค์ฐจ์ ๋ฐ์ดํฐ ์ฒ๋ฆฌ์์ ํ์ ์ถ์ข ์ ๋ถํํฉ๋๋ค.
๊ฐ์ : CT, MRI, PET ๋ฑ ์๋ก ๋ค๋ฅธ ์ฅ๋น์ ์์์ ํ๋๋ก ํฉ์น๋ **์์ ๋ฑ๋ก(Registration)**๊ณผ ํน์ ์ฅ๊ธฐ๋ง ๊ณจ๋ผ๋ด๋ ์ธ๊ทธ๋ฉํ ์ด์ (Segmentation) ๊ธฐ๋ฅ์ด ๋งค์ฐ ๊ฐ๋ ฅํฉ๋๋ค.
ํ์ฅ์ฑ: ์ ์ธ๊ณ ๊ฐ๋ฐ์๋ค์ด ๋ง๋ ์๋ง์ **ํ์ฅ ๋ชจ๋(Extension)**์ ์ค์นํด ๊ธฐ๋ฅ์ ๋ฌดํ๋๋ก ๋๋ฆด ์ ์์ต๋๋ค.
3. PET ์์ ๋ถ์๊ณผ SUV ๊ณ์ฐ
PET(์์ ์ ๋ฐฉ์ถ ๋จ์ธต์ดฌ์) ์์ ๋ถ์์ ํต์ฌ์ SUV(Standardized Uptake Value, ํ์ค ์ญ์ทจ ๊ณ์) ๊ณ์ฐ์ ๋๋ค.
SUV๋?: ๋ชธ ์์ ์ฃผ์ ํ ๋ฐฉ์ฌ์ฑ ์์ฝํ์ด ํน์ ์กฐ์ง(์ฃผ๋ก ์์ธํฌ)์ ์ผ๋ง๋ ๋ง์ด ๋ชจ์๋์ง๋ฅผ ์์น๋ก ๋ํ๋ธ ๊ฒ์ ๋๋ค. ์์ ์ ์ฑ๋๋ฅผ ํ๋จํ๋ ๊ฒฐ์ ์ ์ธ ์งํ๊ฐ ๋ฉ๋๋ค.
3D Slicer์ ์ญํ : PET ์์๊ณผ ํ์ ์ ๋ณด๋ฅผ ๊ฒฐํฉํ์ฌ ์ด ์์น๋ฅผ ์๋์ผ๋ก ๊ณ์ฐํด ์ค๋๋ค.
4. ๐ [์คํ ์์ญ] PET ์์ SUV ๋ถ์ ๋ฐ๋ผํ๊ธฐ
์, ์ด์ ์ค์ ๋ก ๋ฐ๋ผ ํด ๋ณผ ์๊ฐ์ ๋๋ค. ์๋ ์ ์ฐจ๋ฅผ ์ฐจ๊ทผ์ฐจ๊ทผ ๋ฐ์๋ณด์ธ์.
================================================================ [PET SUV ๊ณ์ฐ ์ค์ ํ๋ก์ธ์ค]
1๋จ๊ณ: ๋ฐ์ดํฐ ๋ถ๋ฌ์ค๊ธฐ
PET ์์๊ณผ ํด๋น ํ์์ CT ์์์ 3D Slicer๋ก ๋๋๊ทธํ์ฌ ๋ก๋ํฉ๋๋ค.
2๋จ๊ณ: ๊ด์ฌ ์์ญ(ROI) ์ง์
'Segment Editor' ๋ชจ๋์ ์ด์ด ๋ถ์ํ๊ณ ์ถ์ ๋ถ์(์: ์ข ์)๋ฅผ ์น ํ๊ฑฐ๋ ๊ตฌ์ญ์ ๋๋๋๋ค.
3๋จ๊ณ: SUV ๊ณ์ฐ ๋ชจ๋ ์คํ
๋ฉ๋ด์์ 'PET Standard Uptake Value Computation' ๋ชจ๋์ ๊ฒ์ํ์ฌ ์คํํฉ๋๋ค.
4๋จ๊ณ: ํ์ ์ ๋ณด ์ ๋ ฅ
๋ก๋๋ PET ์์, ํ์ ์ฒด์ค, ๋ฐฉ์ฌ์ฑ ์์ฝํ ์ฃผ์ ๋ ๋ฑ DICOM ํค๋ ์ ๋ณด๋ฅผ ํ์ธํฉ๋๋ค.
5๋จ๊ณ: ๊ฒฐ๊ณผ ํ์ธ
'Apply'๋ฅผ ๋๋ฅด๋ฉด ์ง์ ํ ๊ตฌ์ญ์ ์ต๋ SUV(SUVbw max), ํ๊ท SUV ๋ฑ์ด ํ๋ก ์ฐ์ถ๋ฉ๋๋ค. ================================================================
5. ๊ฐ์ฅ ์ฝ๊ณ ๋น ๋ฅด๊ฒ ๋ฐฐ์ฐ๋ ๊ฟํ
์๊ฐ์ ๊ธ์ ๋๋ค! ์๋ ์์๋๋ก ํ์ตํด ๋ณด์ธ์.
๊ณต์ ๋ฌธ์ ํ์ฉ: 'Slicer Documentation'์ ๊ฐ์ฅ ์ ํํ ๋ณด๋ฌผ ์ง๋์ ๋๋ค.
์ปค๋ฎค๋ํฐ ๊ฐ์ : 'Slicer Community'์์ ์ ์ธ๊ณ ์ ๋ฌธ๊ฐ๋ค์ Q&A๋ฅผ ๊ฒ์ํด ๋ณด์ธ์.
์ํ ๋ฐ์ดํฐ ํ์ฉ: ํ๋ก๊ทธ๋จ ๋ด 'Sample Data' ๋ชจ๋์์ ์ ๊ณตํ๋ ์ค์ PET ๋ฐ์ดํฐ๋ฅผ ๊ฐ์ง๊ณ ๋จผ์ ์ฐ์ตํด ๋ณด๋ ๊ฒ์ด ๊ฐ์ฅ ๋น ๋ฆ ๋๋ค.
6. ๐ฐ [ํฌ์ ๊ฐ์กฐ] ์๋ฃ AI ๋ฐ ์์ ๋ถ์ ๊ด๋ จ ์ ๋ง์ฃผ
3D Slicer์ ๊ฐ์ ์ํํธ์จ์ด ๊ธฐ์ ์ด ๋ฐ์ ํ ์๋ก, ์ด๋ฅผ ์์ฉํํ๊ฑฐ๋ ํ๋์จ์ด์ ์ ๋ชฉํ ๊ธฐ์ ๋ค์ด ์ฃผ๋ชฉ๋ฐ์ต๋๋ค.
๋ฃจ๋ (Lunit): ํ๋ถ ๋ฐ ์ ๋ฐฉ ์์ AI ๋ถ์ ๋ถ์ผ์ ๊ธ๋ก๋ฒ ์ ๋์ฃผ์๋ก, ๋ถ์ ์๋ํ ๊ธฐ์ ์ ํต์ฌ์ฃผ์ ๋๋ค.
๋ทฐ๋ ธ (VUNO): ์๋ฃ ์ธ๊ณต์ง๋ฅ ์๋ฃจ์ ๊ฐ๋ฐ์ฌ๋ก, ์์ ์ง๋จ ๋ณด์กฐ ์ํํธ์จ์ด ์์ฅ์์ ๊ฐ๋ ฅํ ์ ์ง๋ฅผ ๋ค์ง๊ณ ์์ต๋๋ค.
GE ํฌ์ค์ผ์ด (GE HealthCare): PET ์ฅ๋น ํ๋์จ์ด์ ๋ถ์ ์ํํธ์จ์ด๋ฅผ ๋์์ ๋ณด์ ํ ๊ธ๋ก๋ฒ ๊ณต๋ฃก์ ๋๋ค.
๐ก ๋ถ์กฑํ ๋ถ๋ถ ๋ณด์ (Labeling: ์ถ๊ฐ ์ ๋ณด)
[์ถ๊ฐ ์ ๋ณด: DICOM ํค๋์ ์ค์์ฑ] SUV ๊ณ์ฐ์ด ์ ๋๋ค๋ฉด ์ญ์คํ๊ตฌ DICOM ํค๋ ์ ๋ณด๊ฐ ๋๋ฝ๋ ๊ฒ์ ๋๋ค. ํ์์ ๋ชธ๋ฌด๊ฒ, ์ฃผ์ ์๊ฐ, ๋ฐฉ์ฌ๋ฅ ์์น ๋ฑ์ด ํ์ผ ๋ด์ ์ ํํ ๊ธฐ๋ก๋์ด ์์ด์ผ 3D Slicer๊ฐ ๊ณ์ฐ์ ์์ํ ์ ์์ต๋๋ค. ๊ณ์ฐ ์ 'DICOM Metadata'๋ฅผ ๋ฐ๋์ ํ์ธํ์ธ์!
๐ ์ฐธ๊ณ ๋ฌธํ ๋ฐ ์ฐธ์กฐ ์ฌ์ดํธ
3D Slicer ๊ณต์ ํํ์ด์ง:
https://www.slicer.org/ Slicer Community Wiki:
https://www.slicer.org/wiki/Main_Page/SlicerCommunity 3D Slicer Documentation (Latest):
https://slicer.readthedocs.io/en/latest/ PET SUV Computation ๋ชจ๋ ๊ฐ์ด๋:
https://slicer.readthedocs.io/en/latest/user_guide/modules/petstandarduptakevaluecomputation.html
✅ ์์ฝ
3D Slicer๋ ํ๋ฒ๋, MIT ๋ฑ์ด ๋ง๋ ์คํ์์ค ์๋ฃ ์์ ๋ถ์ ํ๋ซํผ์ด๋ค.
์ ์ง๋จ์ ํต์ฌ์ธ PET SUV ๊ณ์ฐ์ ๋ฌด๋ฃ๋ก, ์์ฃผ ์ ๋ฐํ๊ฒ ์ํํ ์ ์๋ค.
๋ถ์ ์ DICOM ํค๋ ์ ๋ณด ํ์ธ์ ํ์์ด๋ฉฐ, Segment Editor๋ก ์์ญ์ ์ง์ ํด์ผ ํ๋ค.
์๋ฃ AI ์์ฅ์ ์ฑ์ฅ๊ณผ ํจ๊ป ๋ฃจ๋, ๋ทฐ๋ ธ, GE ํฌ์ค์ผ์ด ๋ฑ ๊ด๋ จ ๊ธฐ์ ์ ์ฃผ๋ชฉํ ํ์๊ฐ ์๋ค.
ํ๊ทธ: #3DSlicer #PET๋ถ์ #SUV๊ณ์ฐ #์๋ฃ์์AI #๋ฃจ๋ #๋ทฐ๋ ธ #์ฝ๋ฉ๋ฐ๋ผํ๊ธฐ #์๋ฃIT #๋์งํธํฌ์ค์ผ์ด #์์ง๋จ
๋๊ธ
๋๊ธ ์ฐ๊ธฐ