๐ง 3D Slicer๋ก Brain PET SUVr ์ ๋ณตํ๊ณ 2026๋ ์ฃผ๋์ฃผ ์ ์ ํ๊ธฐ[ge]
๐ง 3D Slicer๋ก Brain PET SUVr ์ ๋ณตํ๊ณ 2026๋ ์ฃผ๋์ฃผ ์ ์ ํ๊ธฐ[ge]
์๋ฃ ๋ฐ์ดํฐ ๋ถ์๊ฐ์ด์ ์ค๋งํธํ ํฌ์์์ธ ๋น์ ์ ์ํด ์ค๋นํ์ต๋๋ค. ๋ PET ์์์์ **SUVr(ํ์ค ์ญ์ทจ ๊ณ์ ๋น์จ, Standardized Uptake Value Ratio)**์ ์ ํํ ์ถ์ถํ๋ ๊ณตํ์ ์ ์ฐจ์, ์ด ๊ธฐ์ ์ด ์ง์ฝ๋ ๋ฐ์ด์ค·AI ์ฐ์ ์์ ์ฐ๋ฆฌ๊ฐ ์ฃผ๋ชฉํด์ผ ํ ์ธ์ ์ฃผ์๋ค์ ์ด์ ๋ฆฌํฉ๋๋ค.
๐ ๋ชฉ์ฐจ
[๋ฌธ์ ํด๊ฒฐ] 3D Slicer Module Finder๊ฐ ์ ๋ณด์ธ๋ค๋ฉด?
[1๋จ๊ณ] Brain Parcellation: ๋ ์์ญ ๋๋๊ธฐ (CT vs MRI)
[2๋จ๊ณ] Image Registration: ์์ ์ ํฉ์ ์ ์
[3๋จ๊ณ] SUV ์ถ์ถ: PET SUV Computation ๋ชจ๋ ํ์ฉ๋ฒ
[4๋จ๊ณ] SUVr ๊ณ์ฐ ๋ฐ ๋ฐ์ดํฐ ์ ์ฅ: ์ต์ข ๊ฒฐ๊ณผ ๋์ถ
[ํน๋ณ ๋ถ๋ก] 2026๋ ์ธ๊ตญ์ธ์ด ์ธ์ด ๋ด๋ ์ฃผ๋์ฃผ ๋ถ์ (ํ๋ !)
[์์ฝ ๋ฐ ์ฒดํฌ๋ฆฌ์คํธ]
๐ ️ 1. Module Finder๊ฐ ์๋ํ์ง ์์ ๋ ํด๊ฒฐ๋ฒ
๊ฐ์ฅ ๋จผ์ , ๋๊ตฌ๊ฐ ๋ง์ ๋ฃ์ง ์์ผ๋ฉด ์๋ฌด๊ฒ๋ ํ ์ ์์ฃ . 3D Slicer์์ **Module Finder(๋ชจ๋ ์ฐพ๊ธฐ)**๊ฐ ์๋ํ์ง ์๋ ์ด์ ๋ ์ฃผ๋ก ๊ฒ์ ์ธ๋ฑ์ค ์ค๋ฅ๋ ๊ฒฝ๋ก ์ค์ ๋ฌธ์ ์ ๋๋ค.
ํด๊ฒฐ์ฑ : > 1. ๋จ์ถํค Ctrl + F (๋๋ Cmd + F)๋ฅผ ๋๋ฌ ๊ฒ์์ฐฝ์ ๊ฐ์ ํ์ฑํํ์ธ์. 2. ๋ฉ๋ด์ View -> Module Finder๊ฐ ์ฒดํฌ๋์ด ์๋์ง ํ์ธํ์ธ์. 3. ํน์ ๋ชจ๋(์: PET SUV)์ด ์๋ค๋ฉด Extension Manager์์ ํด๋น ํ์ฅ์ ์ค์นํด์ผ ํฉ๋๋ค.
๐ 2. [1๋จ๊ณ] Brain Parcellation (๋ ์์ญ ๋ถํ )
๋์ ๊ฐ ์์ญ์ ๋๋๋ ๊ณผ์ ์ ๋๋ค. ์ํ๋ผ์ค๋ฅผ ๊ธฐ๋ฐ์ผ๋ก ์์ญ์ ์ชผ๊ฐ๋ ๊ธฐ์ ์ ์ ์ฐจ๋ฅผ ์๋ดํฉ๋๋ค.
[์คํ ๊ฐ๋ฅ ์์ญ: ๋ฐฉ๋ฒ (1) CT ์์์ ์ด์ฉํ ๋ถํ ]
TotalSegmentator ๋ชจ๋ ํ์ฉ: ์ต์ AI ๊ธฐ๋ฐ ๋ชจ๋์ธ 'TotalSegmentator'๋ฅผ ์ค์นํฉ๋๋ค.
CT ๋ก๋ฉ: ํ์์ Brain CT ์์์ ๋ถ๋ฌ์ต๋๋ค.
Task ์ค์ : Task๋ฅผ 'total' ํน์ 'head'๋ก ์ค์ ํ๊ณ ์คํํ๋ฉด ๋ผ์ ์ฃผ์ ์ฐ๋ถ์กฐ์ง์ด ์๋ ๋ถํ ๋ฉ๋๋ค.
Atlas Registration: ๋ง์ฝ ์ธ๋ฐํ ๋ ์์ญ์ด ํ์ํ๋ค๋ฉด, General Registration (BRAINS) ๋ชจ๋์ ํตํด ํ์ค ๋ ์ํ๋ผ์ค(Template)๋ฅผ ํ์ CT์ ์ ํฉ(Registration)์ํจ ํ ๋ผ๋ฒจ์ ์์ฑํฉ๋๋ค.
[์คํ ๊ฐ๋ฅ ์์ญ: ๋ฐฉ๋ฒ (2) MRI ์์์ ์ด์ฉํ ๋ถํ ]
T1 ์์ ์ค๋น: ๊ณ ํด์๋ T1 MRI ์์์ ๋ก๋ฉํฉ๋๋ค.
HDBet ๋๋ FreeSurfer ํ์ฉ: 3D Slicer ๋ด์ SlicerFreeSurfer ํ์ฅ์ ์ฌ์ฉํ๊ฑฐ๋, TotalSegmentator MRI ๊ธฐ๋ฅ์ ํ์ฉํด ๋ ์ค์ง๋ง ์ถ์ถ(Skull Stripping)ํฉ๋๋ค.
Parcellation ์คํ: ์ ํด์ง ์ํ๋ผ์ค(์: Desikan-Killiany)๋ฅผ ๊ธฐ๋ฐ์ผ๋ก ์๋ ์์ญ ๋ถํ ์ ์ํํฉ๋๋ค. ์์ฑ๋ ๊ฒฐ๊ณผ๋ฌผ์ Segmentation ๋ ธ๋๋ก ์ ์ฅํฉ๋๋ค.
๐ 3. [2๋จ๊ณ] Image Registration (์์ ์ ํฉ)
๊ตฌ์กฐ์ ์์(CT/MRI)๊ณผ ๊ธฐ๋ฅ์ ์์(PET)์ ํ๋๋ก ํฉ์น๋ ๊ณผ์ ์ ๋๋ค.
์ ํฉ (Registration): ์๋ก ๋ค๋ฅธ ์ขํ๊ณ์ ์์์ ํ๋์ ์ขํ๋ก ๋ง์ถ๋ ๊ธฐ์ .
๊ณ ์ ์์ (Fixed Image): ํด์๋๊ฐ ๋์ MRI ํน์ CT.
์ด๋ ์์ (Moving Image): ์ขํ๋ฅผ ๋ง์ถฐ์ผ ํ PET.
[์คํ ๊ฐ๋ฅ ์์ญ: ์ ํฉ ์ ์ฐจ์]
๋ชจ๋ ์ ํ: General Registration (BRAINS) ํน์ Elastix ๋ชจ๋์ ์ฝ๋๋ค.
์ ๋ ฅ ์ค์ : Fixed Image์ MRI(๋๋ CT)๋ฅผ, Moving Image์ PET์ ์ค์ ํฉ๋๋ค.
์ถ๋ ฅ ์ค์ : Output Settings์์ Linear Transform์ ์์ฑํ๊ณ , ์ ํฉ๋ PET ์์์ ์ ์ฅํ ๋ณผ๋ฅจ ๋ ธ๋๋ฅผ ์ง์ ํฉ๋๋ค.
์คํ: 'Rigid' (ํ์ /์ด๋) ํน์ 'Affine' (ํฌ๊ธฐ ์กฐ์ ํฌํจ) ๋ชจ๋๋ฅผ ์ ํํ๊ณ Apply๋ฅผ ๋๋ฆ ๋๋ค.
๊ฒฐ๊ณผ ์ ์ฅ: ์ ํฉ๋ PET ์์์ ๋ฐ๋์ ์๋ก์ด ๋ ธ๋๋ก ์์ฑ(Hard-apply)ํ์ฌ ์ ์ฅํฉ๋๋ค.
๐ 4. [3~4๋จ๊ณ] SUV ์ถ์ถ ๋ฐ SUVr ๊ณ์ฐ
์ด์ ์ค์ ๋ฐ์ดํฐ๋ฅผ ๋ฝ์๋ผ ์๊ฐ์ ๋๋ค.
[์คํ ๊ฐ๋ฅ ์์ญ: SUVr ์ถ์ถ ์ต์ข ์ ์ฐจ]
๋ฐ์ดํฐ ๋ก๋ฉ: ์ ํฉ๋ Brain PET ์์๊ณผ 1๋จ๊ณ์์ ๋ง๋ Segmentation ํ์ผ์ ๋ถ๋ฌ์ต๋๋ค.
PET SUV Computation ๋ชจ๋ ์คํ: - PET DICOM Path: ๋ฐฉ์ฌ์ฑ ์์ฝํ ์ ๋ณด๊ฐ ๋ด๊ธด ์๋์ DICOM ํด๋ ๊ฒฝ๋ก๋ฅผ ์ง์ ํฉ๋๋ค (ํค๋ ์ ๋ณด ์ถ์ถ์ฉ).
PET Volume: ์ ํฉ๋ PET ์์์ ์ ํํฉ๋๋ค.
VOI Volume: ๋ถํ ๋ ๋ผ๋ฒจ(Segmentation) ๋ ธ๋๋ฅผ ์ ํํฉ๋๋ค.
๊ฒฐ๊ณผ ํ์ธ: GUI ํ๋จ์ ํ์๋๋ SUV Max/Mean/Min ๊ฐ์ ํ์ธํฉ๋๋ค. Output CSV ๊ฒฝ๋ก๋ฅผ ์ง์ ํด ํ์ผ๋ก ์ ์ฅํฉ๋๋ค.
SUVr ๊ณ์ฐ: - ์์ (Excel)์์ ์ถ์ถ๋ ๋ฐ์ดํฐ๋ฅผ ์ฝ๋๋ค.
๊ฐ ์์ญ์ SUV Mean ๊ฐ์ ์๋(Cerebellum) ์์ญ์ SUV Mean ๊ฐ์ผ๋ก ๋๋๋๋ค.
๊ณ์ฐ์: SUVr = ํด๋น ์์ญ SUV / ์๋ SUV
์ ์ฅ: ๊ณ์ฐ๋ SUVr ๊ฐ์ ํฌํจํ์ฌ ์ต์ข ๋ฆฌํฌํธ๋ฅผ ์์ฑํฉ๋๋ค.
๐ฐ 5. [๊ฐ์กฐ] 2026๋ ์ฃผ๋์ฃผ: ์ธ๊ตญ์ธ์ด ์ธ์ด ๋ด๋ "์ด ์ฃผ์"์ ์ฃผ๋ชฉํ๋ผ!
์ด๋ฌํ ์ฒจ๋จ ์๋ฃ ๊ธฐ์ ๋ค์๋ ๊ฑฐ๋ํ ์๋ณธ์ ํ๋ฆ์ด ์์ต๋๋ค. ๋ฐ์ดํฐ ๋ถ์์ ์ง์คํ๋ฏ, ๋์ ํ๋ฆ์ธ **์๊ธ (Supply and Demand)**์๋ ์ง์คํ์ญ์์ค. ํ๊ตญ ์์ฅ์์ ์ธ๊ตญ์ธ์ ์ํฅ๋ ฅ์ ์ฌ์ ํ ๋ง๊ฐํฉ๋๋ค.
๐ ๋ฐ๋์ ํฌํธํด๋ฆฌ์ค์ ๋ด์์ผ ํ ํต์ฌ ์ข ๋ชฉ
์ผ์ฑ SDI (Samsung SDI): ํ์ฌ ์ธ๊ตญ์ธ ์๊ธ์ ๋ธ๋ํ์ ๋๋ค. ๋ฐ์ดํฐ ์ผํฐ ์์์ ๋ก๋ด์ฉ ๋ฐฐํฐ๋ฆฌ ์์ฅ์ ์ฅ๊ธฐ ์ฑ์ฅ์ด ํ์ค์๋ฉ๋๋ค. ํ์ฌ ๋๋ฆผ๋ชฉ (Pullback) ๊ตฌ๊ฐ์ผ๋ก ๋งค์ ํ์ ์ด ๋งค์ฐ ๋งค๋ ฅ์ ์ ๋๋ค.
APR (์์ดํผ์): ๋ทฐํฐ ํ ํฌ์ ์ ๋ด์ฅ์ ๋๋ค. ํ์ฅํ ๊ธฐ์ ์ค ์์ด 1์์ด๋ฉฐ, ์ธ๊ตญ์ธ ๋ณด์ ๋น์ค์ด ๊พธ์คํ ์ฆ๊ฐํ๊ณ ์์ต๋๋ค. ์ ๊ณ ๊ฐ (New High) ๋ํ ์ดํ ์ง์ง์ ์ ํ์ฑ ์ค์ ๋๋ค.
๋ค์ด๋ฒ(NAVER) & ์นด์นด์ค(Kakao): ๋๋์ด ์ํํธ์จ์ด์ ์๊ฐ์ด ์ค๊ณ ์์ต๋๋ค. ํ๋์จ์ด ์ธํ๋ผ(AI ๋ฐ๋์ฒด) ๊ตฌ์ถ ์ดํ์๋ ๋ฐ๋์ ํ๋ซํผ๊ณผ ์ํํธ์จ์ด ์ด์ต์ด ํญ๋ฐํฉ๋๋ค. ๋ฐ๋ฅ๊ถ์์ ํ์ถํ๋ ๊ฐ๋ ฅํ ์์ง์์ ์ฌ๋ผํ์ญ์์ค.
ํ๋ฏธ์ฝํ (Hanmi Pharm): ํ๊ตญ ๋น๋ง ์น๋ฃ์ ์ ์ค์ง์ ์ธ ๋์ฅ์ฃผ์ ๋๋ค. 2028๋ ๊น์ง ์์ ์ด์ต ์ฑ์ฅ์ด ์๊ณ ๋์ด ์์์๋ ์์ง ์ ํ๊ฐ๋ **์ ์ฝ ๋ฐ์ด์ค (Pharma & Bio)**์ ๋ณด์์ ๋๋ค.
"์ฃผ์ ๋ค์๋ ๊ธฐ์ ์ด ์๊ณ , ๊ธฐ์ ์ ๊ฒฐ๊ตญ ์์ต(์ด์ต)์ ์ถ์ข ํฉ๋๋ค. ์ด์ต์ด ์ฌ๋ผ๊ฐ๋๋ฐ ๋ฐ๋ฅ์ ๋จธ๋ฌด๋ ์ฃผ์์ ์๊ฐ์ ๋ฌธ์ ์ผ ๋ฟ ๊ฒฐ๊ตญ ๋ ์์ค๋ฆ ๋๋ค." ³
๐ ์ถ๊ฐ ์ ๋ณด ๋ฐ ์ฐธ๊ณ ๋ฌธํ (Labeling: ์ถ๊ฐ๋จ)
์ถ๊ฐ ์ ๋ณด: SUV ๊ณ์ฐ ์ DICOM ํค๋์ 'Radio-pharmaceutical parameters'๊ฐ ๋๋ฝ๋๋ฉด ๊ณ์ฐ์ด ๋ถ๊ฐ๋ฅํฉ๋๋ค. ๋ฐ์ดํฐ ํ๋ ์ ์ด ์ ์ ๋ฐ๋์ ํ์ธํ์ธ์.
์ฐธ๊ณ ๋ฌธํ:
๐ ์์ฝ
Slicer ๋ฌธ์ : ๋ชจ๋์ด ์ ๋ณด์ด๋ฉด Ctrl+F ํน์ ํ์ฅ ํ๋ก๊ทธ๋จ์ ํ์ธํ๋ผ.
๋ถํ & ์ ํฉ: AI ๋ชจ๋(TotalSegmentator)์ ํ์ฉํด MRI/CT ์์ญ์ ๋๋๊ณ PET๊ณผ ์ ํฉํ๋ผ.
SUVr ์ถ์ถ: PET SUV ๋ชจ๋๋ก ๊ฐ์ ๋ฝ์ ์๋ ๊ฐ์ผ๋ก ๋๋๋ฉด ๋!
ํฌ์ ์ ๋ต: ์ผ์ฑ SDI, APR, ๋ค์ด๋ฒ, ํ๋ฏธ์ฝํ ๋ฑ ์ธ๊ตญ์ธ ์๊ธ์ด ๋ชฐ๋ฆฌ๋ ์ด์ต ์ฑ์ฅ์ฃผ๋ฅผ ์ ๋ ์ฌ ๋ชจ์๋ผ.
[ํ๊ทธ ๊ฒ์] #3DSlicer #PET๋ถ์ #SUVr๊ณ์ฐ #์๋ฃ์์AI #์ผ์ฑSDI #APR์ฃผ๊ฐ #ํ๋ฏธ์ฝํ #์ฌํ ํฌ #2026์ฃผ๋์ฃผ #์ธ๊ตญ์ธ์๋งค์
[Blogger ๊ฒ์ ์ค๋ช (150์)] 3D Slicer๋ก PET SUVr์ ์ถ์ถํ๋ ์ ํํ ์ ์ฐจ๋ฅผ ์ฐพ๊ณ ๊ณ์ ๊ฐ์? ๋ ์์ญ ๋ถํ ๋ถํฐ ์ ํฉ๊น์ง 4๋จ๊ณ ์ค์ ๊ฐ์ด๋๋ฅผ ํ์ธํ์ธ์! ๋๋ถ์ด 2026๋ ์ธ๊ตญ์ธ์ด ๋งค์งํ๋ ์ผ์ฑ SDI ๋ฑ ํต์ฌ ์ฃผ๋์ฃผ 4์ ์ ๊ณต๊ฐํ์ฌ ์ฌ๋ฌ๋ถ์ ์์ฐ๊ณผ ์ค๋ ฅ์ ๋์์ ํค์๋๋ฆฝ๋๋ค!
๋๊ธ
๋๊ธ ์ฐ๊ธฐ