✅ ADNI ROI Mapping 표 (실전 SUVr용)

 여기서는 ADNI(Alzheimer’s Disease Neuroimaging Initiative) 스타일 SUVr 분석에서 실제로 사용되는 ROI 체계를 기준으로,

MONAI / FreeSurfer / AAL 계열 atlas를 사용할 때 어떻게 매핑하면 되는지를 한눈에 볼 수 있는 표 형태로 정리해 드리겠습니다.

아래 표는 실무에서 가장 많이 쓰이는 ADNI Composite ROI 구성을 기준으로 만들었습니다
(특히 Amyloid / FDG PET SUVr).

✅ ADNI ROI Mapping 표 (실전 SUVr용)

기준: ADNI PET Core / Landau et al. 방식
용도: MONAI Parcellation → PET SUV → SUVr

🧠 1️⃣ ADNI “Cortical Composite” (Amyloid / FDG 핵심 지표)

ADNI에서 가장 많이 사용하는 대표 타깃 ROI 묶음

ADNI Composite포함 영역
FrontalSuperior frontal, Middle frontal, Inferior frontal
TemporalSuperior temporal, Middle temporal
ParietalInferior parietal, Superior parietal, Precuneus
CingulatePosterior cingulate, Anterior cingulate
Total Cortical위 모든 영역 평균

▶ MONAI Brain Parcellation 매핑 예

MONAI 출력 segment 기준:

Left Superior Frontal
Right Superior Frontal
Left Middle Frontal
Right Middle Frontal
Left Inferior Frontal
Right Inferior Frontal

→ Logical Operator → Union
→ 새 ROI:

Frontal

같은 방식으로 Temporal / Parietal / Cingulate 생성

🧠 2️⃣ Posterior Cingulate / Precuneus (AD 초기 민감 ROI)

ADNI에서 가장 먼저 감소/증가를 보는 영역

ADNI ROIMONAI Label
Posterior CingulateLeft/Right Posterior Cingulate
PrecuneusLeft/Right Precuneus

👉 반드시 좌우 합쳐서 사용

🧠 3️⃣ Temporal Meta ROI (Tau / Amyloid 중요)

ADNI ROIMONAI
Inferior TemporalInferior Temporal
Middle TemporalMiddle Temporal
EntorhinalEntorhinal Cortex
FusiformFusiform

Tau PET에서는 특히 중요.

🧠 4️⃣ Reference Region (SUVr 분모)

ADNI 표준:

ADNI ReferenceMONAI
Whole CerebellumLeft Cerebellum + Right Cerebellum

생성 방법 (복습):

Segment Editor → Logical Operators → Union

Left Cerebellum
Right Cerebellum

↓

WholeCerebellum

✅ ADNI 스타일 “최종 SUVr ROI 세트 (추천 최소 구성)”

실제 논문 + 임상에서 가장 많이 쓰는 최소 세트:

ROI
Frontal
Temporal
Parietal
Cingulate
Posterior Cingulate
Precuneus
Whole Cortical Composite
Whole Cerebellum (reference)

⭐ 추천 ROI 구조 (Slicer 내부)

MONAI parcellation 후:

01_Frontal
02_Temporal
03_Parietal
04_Cingulate
05_Precuneus
06_PostCingulate
99_WholeCerebellum

이렇게 번호 붙이면 CSV 정렬이 깔끔합니다.

✅ Whole Cortical Composite 만드는 법

이미 만든:

  • Frontal

  • Temporal

  • Parietal

  • Cingulate

을 다시:

Segment Editor → Logical Operator → Union

↓

CorticalComposite

이것이 ADNI의 대표 SUVr.

🧪 실전 팁 (중요)

✔ SUVmean 사용

ADNI는 항상:

👉 SUVmean

SUVmax ❌

✔ erosion 권장

Reference cerebellum:

Segment Editor → Margin → -2mm

→ CSF contamination 감소

📐 SUVr 공식

Excel:

Target ROI SUVmean = A2
WholeCerebellum SUVmean = B2

=A2/B2

📚 참고문헌

  1. Landau SM et al., 2012
    NeuroImage – Amyloid normalization

  2. Jagust et al., ADNI PET Core methods
    https://adni.loni.usc.edu/methods/pet-analysis/

  3. Jack et al., 2017 NIA-AA Framework

  4. Slicer PET SUV Module
    https://slicer.readthedocs.io/en/latest/user_guide/modules/petstandarduptakevaluecomputation.html

  5. Chen et al., Tau PET reference selection, Brain 2015

✨ 요약

  • ADNI 핵심 ROI = Frontal + Temporal + Parietal + Cingulate

  • Posterior Cingulate / Precuneus 별도 관리

  • Reference = Whole Cerebellum

  • SUVmean 사용

  • erosion -2mm 권장

  • Logical Union으로 Composite 생성




정리 가능:

✅ ADNI ROI 자동 생성 Slicer 파이썬
✅ MONAI label → ADNI ROI 변환 스크립트
✅ CSV → SUVr Excel 템플릿
✅ ADNI 스타일 전체 파이프라인 다이어그램

*지금 단계면 충분히 자동화까지 갈 수 있습니다 👍

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