๐ง ์๋ช ์ ์ค๊ณ๋๋ฅผ ์ ๋ฐ ํ๊ฒฉํ๋ผ: ๋์ ์ฌ์ฅ AI ๋ถํ (Segmentation) ๋ง์คํฐํด๋์ค[ge]
๐ง ์๋ช ์ ์ค๊ณ๋๋ฅผ ์ ๋ฐ ํ๊ฒฉํ๋ผ: ๋์ ์ฌ์ฅ AI ๋ถํ (Segmentation) ๋ง์คํฐํด๋์ค[ge]
์๋ฃ ์ธ๊ณต์ง๋ฅ(AI)๊ณผ ์์ ๋ถ์์ ์ธ๊ณ์์ **'๋ฌด์์ ๋ถํ (Segmentation)ํ๋๋'**๋ ๊ณง **'์ด๋ค ๊ฐ์น๋ฅผ ์ฐฝ์ถํ๋๋'**์ ์ง๊ฒฐ๋ฉ๋๋ค. ์ ๊ตํ๊ณ , ํ๊ณ์ ์ฐ์ ๊ณ์์ ๊ฐ์ฅ ๋ง์ด ์ธ์ฉ๋๋ '๊ธ๋ก๋ฒ ์คํ ๋ค๋' ์ค์ต ์์ ๋ ๊ฐ์ง๋ฅผ ์์ ํ์ต๋๋ค.
๋ณต์กํ ํด๋ถํ์ ๊ตฌ์กฐ๋ฅผ AI๋ก ์ ๋ณตํ๋ ํต์ฌ ๋น๋ฒ์ ์ ์ํด ๋๋ฆฝ๋๋ค.
๋จ์ํ ํด ์ฌ์ฉ๋ฒ์ ๋์ด, ์ ์ธ๊ณ ์ฐ๊ตฌ์๋ค์ด "๊ฐ์ฅ ์๋ฒฝํ๋ค"๊ณ ๊ทน์ฐฌํ๋ ๋ ๊ฐ์ง ํ๋ก์ ํธ๋ฅผ ํตํด ๋น์ ์ ๊ฐ์ ํ๋ฆฌํฐ๋ฅผ ์์ง ์์น์์ผ ๋ณด์ธ์.
๋ชฉ์ฐจ
[๋ ์ ๋ณต] Brain MRI: Atlas-based Segmentation (์ํ๋ผ์ค ๊ธฐ๋ฐ ๋ถํ )
[์ฌ์ฅ & ์ ์ ์ ๋ณต] TotalSegmentator (ํ ํ ์ธ๊ทธ๋ฉํ ์ดํฐ): ์ธ์ฉ ์ง์ 1์์ ์์
๐ฐ ํฌ์ ์ธ์ฌ์ดํธ: ์ ๋ฐ ์๋ฃ(Precision Medicine)์ ์ง๋ฐฐ์๋ค
[์ค๋ฌด ๊ฐ์ด๋] ์ํด๋ฆญ์ผ๋ก ๋๋ด๋ 'TotalSegmentator' ์คํ๋ฒ
์์ฝ ๋ฐ ์ฐธ๊ณ ๋ฌธํ
1. ๐ง ๋(Brain) MRI: ์ธ๋ฅ ์ต๋์ ๋์ ์ ๋์ ํ๋ค
๋๋ ์์ฒ ๊ฐ์ ๋ฏธ์ธํ ๊ตฌ์กฐ๋ก ์ด๋ฃจ์ด์ ธ ์์ต๋๋ค. ์ด ์ค ๊ฐ์ฅ ๋๋ฆฌ ์ธ์ฉ๋๋ ๋ฐฉ์์ **Atlas-based Segmentation(์ํ๋ผ์ค ๊ธฐ๋ฐ ๋ถํ )**์ ๋๋ค. ํ์ค ๋ ์ง๋(Atlas)๋ฅผ ํ์์ ๋ ์์์ ํฌ์ํ์ฌ ๋ฐฑ์ง(White Matter), ํ๋ฐฑ์ง(Grey Matter), ๋์ฒ์์ก(CSF) ๋ฑ์ ๊ตฌ๋ถํฉ๋๋ค.
"๋๋ฅผ ์ดํดํ๋ ๊ฒ์ ์ฐ์ฃผ๋ฅผ ์ดํดํ๋ ๊ฒ๋ณด๋ค ์ด๋ ต์ต๋๋ค. ํ์ง๋ง AI๋ ๊ทธ ์ฐ์ฃผ์ ์ง๋๋ฅผ 1mm ๋จ์๋ก ๊ทธ๋ ค๋ด๊ณ ์์ฃ ." [์ฃผ์1] (์ฃผ์1: ์ ๊ฒฝ๊ณผํ์ ๋ผ๋ง์ฐฌ๋๋์ '๋์ ์ ๋น' ๊ฐ์ฐ ๋ด์ฉ ์ค ์ผ๋ถ ์ฌ๊ตฌ์ฑ)
ํต์ฌ ๋๊ตฌ: SlicerFreeSurfer ๋๋ DeepEdit(MONAI)
ํ์ฉ ๊ฐ์น: ์น๋งค(Alzheimer) ์ง๋จ ๋ฐ ๋์ข ์(Brain Tumor) ๋ถํผ ์ธก์ ์ ํ์ค ๋ชจ๋ธ.
2. ❤️ ์ฌ์ฅ(Heart) & ์ ์ : TotalSegmentator์ ํ๋ช
ํ์ฌ ์๋ฃ ์์ ๋ถ์ ์ปค๋ฎค๋ํฐ์์ ๊ฐ์ฅ ํซํ ํ๋ก์ ํธ๋ ๋จ์ฐ **TotalSegmentator(ํ ํ ์ธ๊ทธ๋ฉํ ์ดํฐ)**์ ๋๋ค. ๋จ ํ ๋ฒ์ ํด๋ฆญ์ผ๋ก ์ฌ์ฅ, ํ, ๊ฐ์ ํฌํจํ 117๊ฐ์ ์ฅ๊ธฐ์ ๋ผ๋ฅผ ์๋์ผ๋ก ๋ถํ ํด ์ค๋๋ค. ์๋ง์ ๋ ผ๋ฌธ์์ ๊ธฐ๋ณธ ๋น๊ต ๋ชจ๋ธ(Baseline)๋ก ์ธ์ฉ๋๊ณ ์์ต๋๋ค.
ํน์ง: ๋ฅ๋ฌ๋(Deep Learning) ๊ธฐ๋ฐ์ ์๋ ๋ถํ .
์ฌ์ฅ ํนํ: ์ฌ๋ฐฉ(Atria), ์ฌ์ค(Ventricles), ๋๋๋งฅ(Aorta) ๋ฑ ์ฌ์ฅ์ ์ธ๋ถ ๊ตฌ์กฐ๋ฅผ ์๋ฆ ๋์ ์ ๋๋ก ์ ํํ๊ฒ ์ก์๋ ๋๋ค.
3. ๐ฐ ํฌ์ํ ์ฃผ์: ์ ๋ฐ ์๋ฃ์ ์ฐ๊ธ์ ์ฌ๋ค
์ ๊ตํ ๋ถํ ๊ธฐ์ ์ ๊ฒฐ๊ตญ **'๋ก๋ด ์์ '**๊ณผ **'๋ง์ถคํ ์ง๋จ'**์ผ๋ก ์ด์ด์ง๋๋ค. ์ด ๋ถ์ผ์ ๋ฏธ๋ ๊ฐ์น๋ฅผ ์ ์ ํ ๊ธฐ์ ๋ค์ ๋๋ค.
1์: NVIDIA (์๋น๋์ / NVDA) ⭐⭐⭐⭐⭐
์ด์ : ์ค๋ช ์ด ํ์ ์์ต๋๋ค. TotalSegmentator์ ๊ฐ์ ๊ฑฐ๋ ๋ฅ๋ฌ๋ ๋ชจ๋ธ์ ๋๋ฆฌ๊ธฐ ์ํ **GPU(๊ทธ๋ํฝ ์ฒ๋ฆฌ ์ฅ์น)**์ ์ ๋ ๊ฐ์์ ๋๋ค. ์๋น๋์์ Clara(ํด๋ผ๋ผ) ํ๋ซํผ์ ์๋ฃ AI์ ํ์ค ์ธํ๋ผ์ ๋๋ค.
2์: Intuitive Surgical (์ธํ์ดํฐ๋ธ ์์ง์ปฌ / ISRG) ⭐⭐⭐⭐
์ด์ : ๋ค๋น์น ์์ ๋ก๋ด์ ์ ์กฐ์ฌ์ ๋๋ค. AI๊ฐ ๋ถํ (Segmentation)ํ 3D ์ง๋๋ฅผ ์์ ๋ก๋ด์ด ์ค์๊ฐ์ผ๋ก ๋ณด๋ฉด์ ์์ ํ๋ '๋ค๋น๊ฒ์ด์ ์์ ' ์๋์ ์ฃผ์ธ๊ณต์ ๋๋ค.
3์: Siemens Healthineers (์ง๋ฉ์ค ํฌ์๋์ด์ค / SHL) ⭐⭐⭐
์ด์ : ํ๋์จ์ด(MRI/CT)์ ์์ฒด AI ๋ถ์ ์ํํธ์จ์ด๋ฅผ ๊ฐ์ฅ ์ ๊ฒฐํฉํ ๊ธฐ์ ์ ๋๋ค. AI ๋ถํ ๊ธฐ์ ์ ์ฅ๋น ์์ฒด์ ๋ด์ฅํ๊ณ ์์ต๋๋ค.
4. ๐ ️ [์ค๋ฌด ๊ฐ์ด๋] 117๊ฐ ์ฅ๊ธฐ๋ฅผ ํ ๋ฒ์! TotalSegmentator ์ค์ต
์๊ฐ์๋ค์ด "์!" ํ๊ณ ํ์ฑ์ ์ง๋ฅผ ๋งํ ๊ฐ์ฅ ๊ฐ๋ ฅํ ์คํ ๊ฐ๋ฅ ์์ญ์ ๋๋ค.
[์คํ ๊ฐ๋ฅ ์์ญ: 3D Slicer์์ ์๋ ๋ถํ ์คํํ๊ธฐ]
1๋จ๊ณ: ํ์ฅ ํ๋ก๊ทธ๋จ(Extension) ์ค์น
3D Slicer ์๋จ์
View->Extensions Manager๋ฅผ ํด๋ฆญํฉ๋๋ค.**'TotalSegmentator'**๋ฅผ ๊ฒ์ํ์ฌ ์ค์นํ๊ณ ํ๋ก๊ทธ๋จ์ ์ฌ์์ํฉ๋๋ค.
2๋จ๊ณ: ์์ ๋ฐ์ดํฐ ๋ถ๋ฌ์ค๊ธฐ
CT ์์์ ๋ถ๋ฌ์ต๋๋ค. (์๋ค๋ฉด
Sample Data๋ชจ๋์์ 'CT Chest'๋ฅผ ๋ค์ด๋ก๋ํ์ธ์.)
3๋จ๊ณ: ์๋ ๋ถํ ๊ฐ๋
์๋จ ๋ฉ๋ด์์
TotalSegmentator๋ชจ๋์ ์ ํํฉ๋๋ค.Input Volume์ ๋ถ๋ฌ์จ ์์์ ์ง์ ํฉ๋๋ค.Taskํญ๋ชฉ์์ 'total' (์ ์ ) ํน์ 'heart' (์ฌ์ฅ ํนํ)๋ฅผ ์ ํํฉ๋๋ค.'Apply' ๋ฒํผ์ ๋๋ฅด๊ณ ์ฝ 1~2๋ถ๊ฐ ๊ธฐ๋ค๋ฆฝ๋๋ค. (AI๊ฐ ์ฐ์ฐ์ ์์ํฉ๋๋ค!)
4๋จ๊ณ: ๊ฒฐ๊ณผ ํ์ธ
3D ํ๋ฉด์ ํ๋ คํ๊ฒ ๋ํ๋๋ ์ฅ๊ธฐ๋ค์ ํ์ธํ๊ณ , ๊ฐ ์ฅ๊ธฐ์ ๋ถํผ(Volume) ๋ฐ์ดํฐ๋ฅผ ์์ ๋ก ์ถ์ถํด ๋ณด์ธ์.
[๋ผ๋ฒจ๋ง: ์ถ๊ฐ ์ ๋ณด] ์ '์ ๋ฐ ๋ถํ '์ธ๊ฐ?
๋จ์ํ ๊ทธ๋ฆผ์ ๊ทธ๋ฆฌ๋ ๊ฒ์ด ๋ชฉ์ ์ด ์๋๋๋ค. ์ ๋ฐ ๋ถํ ์ด ๋๋ฉด Radiomics(๋ผ๋์ค๋ฏน์ค) ๊ธฐ์ ์ ํตํด ์ข ์์ ์ง๊ฐ, ํจํด ๋ฑ ์ธ๊ฐ์ ๋์ผ๋ก ๋ณผ ์ ์๋ ๋ฏธ์ธ ๋ฐ์ดํฐ๋ฅผ ์ถ์ถํ ์ ์์ต๋๋ค. ์ด๊ฒ์ด ๋ฐ๋ก '๋ฐ์ดํฐ ๊ธฐ๋ฐ ์ ๋ฐ ์๋ฃ'์ ์์์ ๋๋ค.
๐ ์ฐธ๊ณ ๋ฌธํ
Wasserthal et al., "TotalSegmentator: Robust Segmentation of 117 Anatomical Structures in CT Images", 2023.
FreeSurfer Project, "Automated Analysis of Human Brain Morphometry" (
).https://surfer.nmr.mgh.harvard.edu/ NVIDIA Clara Holoscan for Medical Imaging (
).https://developer.nvidia.com/clara
๐ ์์ฝ
๋(Brain) ์ค์ต์ Atlas-based ๋ฐฉ์์ ํตํด ์ ๋ฐํ ํด๋ถํ์ ๊ตฌ์กฐ๋ฅผ ๋ฐฐ์ฐ๋ ๋ฐ ์ ํฉํ๋ค.
์ฌ์ฅ ๋ฐ ์ ์ ์ค์ต์ TotalSegmentator๋ฅผ ํตํด ์ต์ ๋ฅ๋ฌ๋ AI์ ์๋ ฅ์ ์ฒดํํ๊ธฐ์ ๊ฐ์ฅ ์ข๋ค.
์๋ฃ ์์์ ์๋ํ๋ NVIDIA ํ๋์จ์ด์ Intuitive Surgical์ ๋ก๋ด ๊ธฐ์ ๋ก ์์ฑ๋๋ค.
์ค์ต ์ Extensions Manager๋ฅผ ํ์ฉํด ๊ฒ์ฆ๋ ์๊ณ ๋ฆฌ์ฆ์ ์ง์ ๊ตฌ๋ํ๋ ๊ฒ์ด ํต์ฌ์ด๋ค.
๐ ํ๊ทธ ๊ฒ์
#์ ๋ฐ์๋ฃ #TotalSegmentator #๋MRI๋ถ์ #์ฌ์ฅ๋ถํ #NVIDIA #ISRG #์ง๋ฉ์ค #3DSlicer์ค์ต #์๋ฃAI๊ฐ์ #๋ก๋ด์์ #๋ผ๋์ค๋ฏน์ค #๋ฐ์ดํฐ์ฌ์ด์ธํฐ์คํธ
๋๊ธ
๋๊ธ ์ฐ๊ธฐ