๐Ÿง  ์ƒ๋ช…์˜ ์„ค๊ณ„๋„๋ฅผ ์ •๋ฐ€ ํƒ€๊ฒฉํ•˜๋ผ: ๋‡Œ์™€ ์‹ฌ์žฅ AI ๋ถ„ํ• (Segmentation) ๋งˆ์Šคํ„ฐํด๋ž˜์Šค[ge]

๐Ÿง  ์ƒ๋ช…์˜ ์„ค๊ณ„๋„๋ฅผ ์ •๋ฐ€ ํƒ€๊ฒฉํ•˜๋ผ: ๋‡Œ์™€ ์‹ฌ์žฅ AI ๋ถ„ํ• (Segmentation) ๋งˆ์Šคํ„ฐํด๋ž˜์Šค[ge]

 ์˜๋ฃŒ ์ธ๊ณต์ง€๋Šฅ(AI)๊ณผ ์˜์ƒ ๋ถ„์„์˜ ์„ธ๊ณ„์—์„œ **'๋ฌด์—‡์„ ๋ถ„ํ• (Segmentation)ํ•˜๋А๋ƒ'**๋Š” ๊ณง **'์–ด๋–ค ๊ฐ€์น˜๋ฅผ ์ฐฝ์ถœํ•˜๋А๋ƒ'**์™€ ์ง๊ฒฐ๋ฉ๋‹ˆ๋‹ค. ์ •๊ตํ•˜๊ณ , ํ•™๊ณ„์™€ ์‚ฐ์—…๊ณ„์—์„œ ๊ฐ€์žฅ ๋งŽ์ด ์ธ์šฉ๋˜๋Š” '๊ธ€๋กœ๋ฒŒ ์Šคํƒ ๋‹ค๋“œ' ์‹ค์Šต ์˜ˆ์ œ ๋‘ ๊ฐ€์ง€๋ฅผ ์—„์„ ํ–ˆ์Šต๋‹ˆ๋‹ค.

๋ณต์žกํ•œ ํ•ด๋ถ€ํ•™์  ๊ตฌ์กฐ๋ฅผ AI๋กœ ์ •๋ณตํ•˜๋Š” ํ•ต์‹ฌ ๋น„๋ฒ•์„ ์ „์ˆ˜ํ•ด ๋“œ๋ฆฝ๋‹ˆ๋‹ค.


๋‹จ์ˆœํ•œ ํˆด ์‚ฌ์šฉ๋ฒ•์„ ๋„˜์–ด, ์ „ ์„ธ๊ณ„ ์—ฐ๊ตฌ์ž๋“ค์ด "๊ฐ€์žฅ ์™„๋ฒฝํ•˜๋‹ค"๊ณ  ๊ทน์ฐฌํ•˜๋Š” ๋‘ ๊ฐ€์ง€ ํ”„๋กœ์ ํŠธ๋ฅผ ํ†ตํ•ด ๋‹น์‹ ์˜ ๊ฐ•์˜ ํ€„๋ฆฌํ‹ฐ๋ฅผ ์ˆ˜์ง ์ƒ์Šน์‹œ์ผœ ๋ณด์„ธ์š”.

๋ชฉ์ฐจ

  1. [๋‡Œ ์ •๋ณต] Brain MRI: Atlas-based Segmentation (์•„ํ‹€๋ผ์Šค ๊ธฐ๋ฐ˜ ๋ถ„ํ• )

  2. [์‹ฌ์žฅ & ์ „์‹  ์ •๋ณต] TotalSegmentator (ํ† ํƒˆ ์„ธ๊ทธ๋ฉ˜ํ…Œ์ดํ„ฐ): ์ธ์šฉ ์ง€์ˆ˜ 1์œ„์˜ ์œ„์—„

  3. ๐Ÿ’ฐ ํˆฌ์ž ์ธ์‚ฌ์ดํŠธ: ์ •๋ฐ€ ์˜๋ฃŒ(Precision Medicine)์˜ ์ง€๋ฐฐ์ž๋“ค

  4. [์‹ค๋ฌด ๊ฐ€์ด๋“œ] ์›ํด๋ฆญ์œผ๋กœ ๋๋‚ด๋Š” 'TotalSegmentator' ์‹คํ–‰๋ฒ•

  5. ์š”์•ฝ ๋ฐ ์ฐธ๊ณ ๋ฌธํ—Œ


1. ๐Ÿง  ๋‡Œ(Brain) MRI: ์ธ๋ฅ˜ ์ตœ๋Œ€์˜ ๋‚œ์ œ์— ๋„์ „ํ•˜๋‹ค

๋‡Œ๋Š” ์ˆ˜์ฒœ ๊ฐœ์˜ ๋ฏธ์„ธํ•œ ๊ตฌ์กฐ๋กœ ์ด๋ฃจ์–ด์ ธ ์žˆ์Šต๋‹ˆ๋‹ค. ์ด ์ค‘ ๊ฐ€์žฅ ๋„๋ฆฌ ์ธ์šฉ๋˜๋Š” ๋ฐฉ์‹์€ **Atlas-based Segmentation(์•„ํ‹€๋ผ์Šค ๊ธฐ๋ฐ˜ ๋ถ„ํ• )**์ž…๋‹ˆ๋‹ค. ํ‘œ์ค€ ๋‡Œ ์ง€๋„(Atlas)๋ฅผ ํ™˜์ž์˜ ๋‡Œ ์˜์ƒ์— ํˆฌ์˜ํ•˜์—ฌ ๋ฐฑ์งˆ(White Matter), ํšŒ๋ฐฑ์งˆ(Grey Matter), ๋‡Œ์ฒ™์ˆ˜์•ก(CSF) ๋“ฑ์„ ๊ตฌ๋ถ„ํ•ฉ๋‹ˆ๋‹ค.

"๋‡Œ๋ฅผ ์ดํ•ดํ•˜๋Š” ๊ฒƒ์€ ์šฐ์ฃผ๋ฅผ ์ดํ•ดํ•˜๋Š” ๊ฒƒ๋ณด๋‹ค ์–ด๋ ต์Šต๋‹ˆ๋‹ค. ํ•˜์ง€๋งŒ AI๋Š” ๊ทธ ์šฐ์ฃผ์˜ ์ง€๋„๋ฅผ 1mm ๋‹จ์œ„๋กœ ๊ทธ๋ ค๋‚ด๊ณ  ์žˆ์ฃ ." [์ฃผ์„1] (์ฃผ์„1: ์‹ ๊ฒฝ๊ณผํ•™์ž ๋ผ๋งˆ์ฐฌ๋“œ๋ž€์˜ '๋‡Œ์˜ ์‹ ๋น„' ๊ฐ•์—ฐ ๋‚ด์šฉ ์ค‘ ์ผ๋ถ€ ์žฌ๊ตฌ์„ฑ)

  • ํ•ต์‹ฌ ๋„๊ตฌ: SlicerFreeSurfer ๋˜๋Š” DeepEdit(MONAI)

  • ํ™œ์šฉ ๊ฐ€์น˜: ์น˜๋งค(Alzheimer) ์ง„๋‹จ ๋ฐ ๋‡Œ์ข…์–‘(Brain Tumor) ๋ถ€ํ”ผ ์ธก์ •์˜ ํ‘œ์ค€ ๋ชจ๋ธ.


2. ❤️ ์‹ฌ์žฅ(Heart) & ์ „์‹ : TotalSegmentator์˜ ํ˜๋ช…

ํ˜„์žฌ ์˜๋ฃŒ ์˜์ƒ ๋ถ„์„ ์ปค๋ฎค๋‹ˆํ‹ฐ์—์„œ ๊ฐ€์žฅ ํ•ซํ•œ ํ”„๋กœ์ ํŠธ๋Š” ๋‹จ์—ฐ **TotalSegmentator(ํ† ํƒˆ ์„ธ๊ทธ๋ฉ˜ํ…Œ์ดํ„ฐ)**์ž…๋‹ˆ๋‹ค. ๋‹จ ํ•œ ๋ฒˆ์˜ ํด๋ฆญ์œผ๋กœ ์‹ฌ์žฅ, ํ, ๊ฐ„์„ ํฌํ•จํ•œ 117๊ฐœ์˜ ์žฅ๊ธฐ์™€ ๋ผˆ๋ฅผ ์ž๋™์œผ๋กœ ๋ถ„ํ• ํ•ด ์ค๋‹ˆ๋‹ค. ์ˆ˜๋งŽ์€ ๋…ผ๋ฌธ์—์„œ ๊ธฐ๋ณธ ๋น„๊ต ๋ชจ๋ธ(Baseline)๋กœ ์ธ์šฉ๋˜๊ณ  ์žˆ์Šต๋‹ˆ๋‹ค.

  • ํŠน์ง•: ๋”ฅ๋Ÿฌ๋‹(Deep Learning) ๊ธฐ๋ฐ˜์˜ ์ž๋™ ๋ถ„ํ• .

  • ์‹ฌ์žฅ ํŠนํ™”: ์‹ฌ๋ฐฉ(Atria), ์‹ฌ์‹ค(Ventricles), ๋Œ€๋™๋งฅ(Aorta) ๋“ฑ ์‹ฌ์žฅ์˜ ์„ธ๋ถ€ ๊ตฌ์กฐ๋ฅผ ์†Œ๋ฆ„ ๋‹์„ ์ •๋„๋กœ ์ •ํ™•ํ•˜๊ฒŒ ์žก์•„๋ƒ…๋‹ˆ๋‹ค.


3. ๐Ÿ’ฐ ํˆฌ์žํ•  ์ฃผ์‹: ์ •๋ฐ€ ์˜๋ฃŒ์˜ ์—ฐ๊ธˆ์ˆ ์‚ฌ๋“ค

์ •๊ตํ•œ ๋ถ„ํ•  ๊ธฐ์ˆ ์€ ๊ฒฐ๊ตญ **'๋กœ๋ด‡ ์ˆ˜์ˆ '**๊ณผ **'๋งž์ถคํ˜• ์ง„๋‹จ'**์œผ๋กœ ์ด์–ด์ง‘๋‹ˆ๋‹ค. ์ด ๋ถ„์•ผ์˜ ๋ฏธ๋ž˜ ๊ฐ€์น˜๋ฅผ ์„ ์ ํ•œ ๊ธฐ์—…๋“ค์ž…๋‹ˆ๋‹ค.

1์œ„: NVIDIA (์—”๋น„๋””์•„ / NVDA) ⭐⭐⭐⭐⭐

  • ์ด์œ : ์„ค๋ช…์ด ํ•„์š” ์—†์Šต๋‹ˆ๋‹ค. TotalSegmentator์™€ ๊ฐ™์€ ๊ฑฐ๋Œ€ ๋”ฅ๋Ÿฌ๋‹ ๋ชจ๋ธ์„ ๋Œ๋ฆฌ๊ธฐ ์œ„ํ•œ **GPU(๊ทธ๋ž˜ํ”ฝ ์ฒ˜๋ฆฌ ์žฅ์น˜)**์˜ ์ ˆ๋Œ€ ๊ฐ•์ž์ž…๋‹ˆ๋‹ค. ์—”๋น„๋””์•„์˜ Clara(ํด๋ผ๋ผ) ํ”Œ๋žซํผ์€ ์˜๋ฃŒ AI์˜ ํ‘œ์ค€ ์ธํ”„๋ผ์ž…๋‹ˆ๋‹ค.

2์œ„: Intuitive Surgical (์ธํŠœ์ดํ‹ฐ๋ธŒ ์„œ์ง€์ปฌ / ISRG) ⭐⭐⭐⭐

  • ์ด์œ : ๋‹ค๋นˆ์น˜ ์ˆ˜์ˆ  ๋กœ๋ด‡์˜ ์ œ์กฐ์‚ฌ์ž…๋‹ˆ๋‹ค. AI๊ฐ€ ๋ถ„ํ• (Segmentation)ํ•œ 3D ์ง€๋„๋ฅผ ์ˆ˜์ˆ  ๋กœ๋ด‡์ด ์‹ค์‹œ๊ฐ„์œผ๋กœ ๋ณด๋ฉด์„œ ์ˆ˜์ˆ ํ•˜๋Š” '๋„ค๋น„๊ฒŒ์ด์…˜ ์ˆ˜์ˆ ' ์‹œ๋Œ€์˜ ์ฃผ์ธ๊ณต์ž…๋‹ˆ๋‹ค.

3์œ„: Siemens Healthineers (์ง€๋ฉ˜์Šค ํ—ฌ์‹œ๋‹ˆ์–ด์Šค / SHL) ⭐⭐⭐

  • ์ด์œ : ํ•˜๋“œ์›จ์–ด(MRI/CT)์™€ ์ž์ฒด AI ๋ถ„์„ ์†Œํ”„ํŠธ์›จ์–ด๋ฅผ ๊ฐ€์žฅ ์ž˜ ๊ฒฐํ•ฉํ•œ ๊ธฐ์—…์ž…๋‹ˆ๋‹ค. AI ๋ถ„ํ•  ๊ธฐ์ˆ ์„ ์žฅ๋น„ ์ž์ฒด์— ๋‚ด์žฅํ•˜๊ณ  ์žˆ์Šต๋‹ˆ๋‹ค.


4. ๐Ÿ› ️ [์‹ค๋ฌด ๊ฐ€์ด๋“œ] 117๊ฐœ ์žฅ๊ธฐ๋ฅผ ํ•œ ๋ฒˆ์—! TotalSegmentator ์‹ค์Šต

์ˆ˜๊ฐ•์ƒ๋“ค์ด "์™€!" ํ•˜๊ณ  ํƒ„์„ฑ์„ ์ง€๋ฅผ ๋งŒํ•œ ๊ฐ€์žฅ ๊ฐ•๋ ฅํ•œ ์‹คํ–‰ ๊ฐ€๋Šฅ ์˜์—ญ์ž…๋‹ˆ๋‹ค.


[์‹คํ–‰ ๊ฐ€๋Šฅ ์˜์—ญ: 3D Slicer์—์„œ ์ž๋™ ๋ถ„ํ•  ์‹คํ–‰ํ•˜๊ธฐ]

1๋‹จ๊ณ„: ํ™•์žฅ ํ”„๋กœ๊ทธ๋žจ(Extension) ์„ค์น˜

  • 3D Slicer ์ƒ๋‹จ์˜ View -> Extensions Manager๋ฅผ ํด๋ฆญํ•ฉ๋‹ˆ๋‹ค.

  • **'TotalSegmentator'**๋ฅผ ๊ฒ€์ƒ‰ํ•˜์—ฌ ์„ค์น˜ํ•˜๊ณ  ํ”„๋กœ๊ทธ๋žจ์„ ์žฌ์‹œ์ž‘ํ•ฉ๋‹ˆ๋‹ค.

2๋‹จ๊ณ„: ์˜์ƒ ๋ฐ์ดํ„ฐ ๋ถˆ๋Ÿฌ์˜ค๊ธฐ

  • CT ์˜์ƒ์„ ๋ถˆ๋Ÿฌ์˜ต๋‹ˆ๋‹ค. (์—†๋‹ค๋ฉด Sample Data ๋ชจ๋“ˆ์—์„œ 'CT Chest'๋ฅผ ๋‹ค์šด๋กœ๋“œํ•˜์„ธ์š”.)

3๋‹จ๊ณ„: ์ž๋™ ๋ถ„ํ•  ๊ฐ€๋™

  • ์ƒ๋‹จ ๋ฉ”๋‰ด์—์„œ TotalSegmentator ๋ชจ๋“ˆ์„ ์„ ํƒํ•ฉ๋‹ˆ๋‹ค.

  • Input Volume์— ๋ถˆ๋Ÿฌ์˜จ ์˜์ƒ์„ ์ง€์ •ํ•ฉ๋‹ˆ๋‹ค.

  • Task ํ•ญ๋ชฉ์—์„œ 'total' (์ „์‹ ) ํ˜น์€ 'heart' (์‹ฌ์žฅ ํŠนํ™”)๋ฅผ ์„ ํƒํ•ฉ๋‹ˆ๋‹ค.

  • 'Apply' ๋ฒ„ํŠผ์„ ๋ˆ„๋ฅด๊ณ  ์•ฝ 1~2๋ถ„๊ฐ„ ๊ธฐ๋‹ค๋ฆฝ๋‹ˆ๋‹ค. (AI๊ฐ€ ์—ฐ์‚ฐ์„ ์‹œ์ž‘ํ•ฉ๋‹ˆ๋‹ค!)

4๋‹จ๊ณ„: ๊ฒฐ๊ณผ ํ™•์ธ

  • 3D ํ™”๋ฉด์— ํ™”๋ คํ•˜๊ฒŒ ๋‚˜ํƒ€๋‚˜๋Š” ์žฅ๊ธฐ๋“ค์„ ํ™•์ธํ•˜๊ณ , ๊ฐ ์žฅ๊ธฐ์˜ ๋ถ€ํ”ผ(Volume) ๋ฐ์ดํ„ฐ๋ฅผ ์—‘์…€๋กœ ์ถ”์ถœํ•ด ๋ณด์„ธ์š”.



[๋ผ๋ฒจ๋ง: ์ถ”๊ฐ€ ์ •๋ณด] ์™œ '์ •๋ฐ€ ๋ถ„ํ• '์ธ๊ฐ€?

๋‹จ์ˆœํžˆ ๊ทธ๋ฆผ์„ ๊ทธ๋ฆฌ๋Š” ๊ฒƒ์ด ๋ชฉ์ ์ด ์•„๋‹™๋‹ˆ๋‹ค. ์ •๋ฐ€ ๋ถ„ํ• ์ด ๋˜๋ฉด Radiomics(๋ผ๋””์˜ค๋ฏน์Šค) ๊ธฐ์ˆ ์„ ํ†ตํ•ด ์ข…์–‘์˜ ์งˆ๊ฐ, ํŒจํ„ด ๋“ฑ ์ธ๊ฐ„์˜ ๋ˆˆ์œผ๋กœ ๋ณผ ์ˆ˜ ์—†๋Š” ๋ฏธ์„ธ ๋ฐ์ดํ„ฐ๋ฅผ ์ถ”์ถœํ•  ์ˆ˜ ์žˆ์Šต๋‹ˆ๋‹ค. ์ด๊ฒƒ์ด ๋ฐ”๋กœ '๋ฐ์ดํ„ฐ ๊ธฐ๋ฐ˜ ์ •๋ฐ€ ์˜๋ฃŒ'์˜ ์‹œ์ž‘์ž…๋‹ˆ๋‹ค.


๐Ÿ“š ์ฐธ๊ณ ๋ฌธํ—Œ

  1. Wasserthal et al., "TotalSegmentator: Robust Segmentation of 117 Anatomical Structures in CT Images", 2023.

  2. FreeSurfer Project, "Automated Analysis of Human Brain Morphometry" (https://surfer.nmr.mgh.harvard.edu/).

  3. NVIDIA Clara Holoscan for Medical Imaging (https://developer.nvidia.com/clara).


๐Ÿ’Ž ์š”์•ฝ

  1. ๋‡Œ(Brain) ์‹ค์Šต์€ Atlas-based ๋ฐฉ์‹์„ ํ†ตํ•ด ์ •๋ฐ€ํ•œ ํ•ด๋ถ€ํ•™์  ๊ตฌ์กฐ๋ฅผ ๋ฐฐ์šฐ๋Š” ๋ฐ ์ ํ•ฉํ•˜๋‹ค.

  2. ์‹ฌ์žฅ ๋ฐ ์ „์‹  ์‹ค์Šต์€ TotalSegmentator๋ฅผ ํ†ตํ•ด ์ตœ์‹  ๋”ฅ๋Ÿฌ๋‹ AI์˜ ์œ„๋ ฅ์„ ์ฒดํ—˜ํ•˜๊ธฐ์— ๊ฐ€์žฅ ์ข‹๋‹ค.

  3. ์˜๋ฃŒ ์˜์ƒ์˜ ์ž๋™ํ™”๋Š” NVIDIA ํ•˜๋“œ์›จ์–ด์™€ Intuitive Surgical์˜ ๋กœ๋ด‡ ๊ธฐ์ˆ ๋กœ ์™„์„ฑ๋œ๋‹ค.

  4. ์‹ค์Šต ์‹œ Extensions Manager๋ฅผ ํ™œ์šฉํ•ด ๊ฒ€์ฆ๋œ ์•Œ๊ณ ๋ฆฌ์ฆ˜์„ ์ง์ ‘ ๊ตฌ๋™ํ•˜๋Š” ๊ฒƒ์ด ํ•ต์‹ฌ์ด๋‹ค.


๐Ÿ” ํƒœ๊ทธ ๊ฒ€์ƒ‰

#์ •๋ฐ€์˜๋ฃŒ #TotalSegmentator #๋‡ŒMRI๋ถ„์„ #์‹ฌ์žฅ๋ถ„ํ•  #NVIDIA #ISRG #์ง€๋ฉ˜์Šค #3DSlicer์‹ค์Šต #์˜๋ฃŒAI๊ฐ•์˜ #๋กœ๋ด‡์ˆ˜์ˆ  #๋ผ๋””์˜ค๋ฏน์Šค #๋ฐ์ดํ„ฐ์‚ฌ์ด์–ธํ‹ฐ์ŠคํŠธ

๋Œ“๊ธ€

์ด ๋ธ”๋กœ๊ทธ์˜ ์ธ๊ธฐ ๊ฒŒ์‹œ๋ฌผ

ํžˆ๋ธŒ๋ฆฌ์ธ, ์ด์Šค๋ผ์—˜์ธ, ์œ ๋Œ€์ธ ์„ฑ๊ฒฝ ์† ์ด๋ฆ„์— ์ˆจ๊ฒจ์ง„ ์†Œ๋ฆ„ ๋‹๋Š” ๋น„๋ฐ€

์ž‘์€ ํ‹ˆ์ด ๋ฌด๋„ˆ๋œจ๋ฆฐ๋‹ค ์™œ ์šฐ๋ฆฌ๋Š” ‘์‚ฌ์†Œํ•œ ๋ถ„์—ด’์„ ๊ทน๋„๋กœ ๊ฒฝ๊ณ„ํ•ด์•ผ ํ•˜๋Š”๊ฐ€

์ž‘์€ ํ‹ˆ์ด ๋ฌด๋„ˆ๋œจ๋ฆฐ๋‹ค ์™œ ์„ฑ๊ฒฝ์€ ‘๋ถ„์—ด์˜ ์‹œ์ž‘’์„ ๊ทธ๋ ‡๊ฒŒ ๊ฒฝ๊ณ ํ•˜๋Š”๊ฐ€