✅ FreeSurfer aparc → MONAI Label 대응표 (핵심 ROI 중심)

 이건 실무에서 정말 많이 막히는 지점입니다.

핵심부터 정리하면:

  • FreeSurfer aparc (Desikan–Killiany) 와

  • MONAI Brain Parcellation (Slicer MONAI Label 기본 모델)

은 대부분 동일한 해부학적 체계(DK 계열) 를 쓰지만,

👉 이름 규칙 + 좌우 표기 + 일부 세분화 방식 이 다릅니다.

아래는 ADNI SUVr / PET ROI 분석에 바로 쓰는 “실전 대응표” 입니다
(FreeSurfer aparc → MONAI Segment Name).

✅ FreeSurfer aparc → MONAI Label 대응표 (핵심 ROI 중심)

기준
FreeSurfer: aparc+aseg (Desikan–Killiany)
MONAI: Slicer MONAI Brain Parcellation 기본 모델

좌우는 반드시 합쳐서 사용하세요 (SUVr 기준).

🧠 Frontal

FreeSurfer aparcMONAI
superiorfrontalSuperior Frontal
middlefrontalMiddle Frontal
inferiorfrontalInferior Frontal
rostralmiddlefrontalMiddle Frontal
caudalmiddlefrontalMiddle Frontal
parsopercularisInferior Frontal
parstriangularisInferior Frontal
parsorbitalisInferior Frontal
medialorbitofrontalMedial Orbital Frontal
lateralorbitofrontalLateral Orbital Frontal
frontalpoleFrontal Pole

🧠 Temporal

FreeSurferMONAI
superiortemporalSuperior Temporal
middletemporalMiddle Temporal
inferiortemporalInferior Temporal
entorhinalEntorhinal
fusiformFusiform
temporalpoleTemporal Pole
banksstsSuperior Temporal

🧠 Parietal

FreeSurferMONAI
inferiorparietalInferior Parietal
superiorparietalSuperior Parietal
supramarginalSupramarginal
precuneusPrecuneus
postcentralPostcentral

🧠 Cingulate (ADNI 핵심)

FreeSurferMONAI
posteriorcingulatePosterior Cingulate
caudalanteriorcingulateAnterior Cingulate
rostralanteriorcingulateAnterior Cingulate
isthmuscingulatePosterior Cingulate

🧠 Occipital

FreeSurferMONAI
lateraloccipitalLateral Occipital
lingualLingual
cuneusCuneus
pericalcarinePericalcarine

🧠 Reference Region (SUVr)

FreeSurferMONAI
cerebellum-cortexCerebellum
cerebellum-white-matterCerebellum

→ MONAI에서는:

Left Cerebellum
Right Cerebellum

Union → WholeCerebellum

✅ ADNI Composite ROI 대응 (요약)

Cortical Composite

FreeSurfer:

frontal + temporal + parietal + cingulate

MONAI:

Superior/Middle/Inferior Frontal
Superior/Middle Temporal
Inferior/Superior Parietal + Precuneus
Anterior/Posterior Cingulate

Logical Union

↓

CorticalComposite

⭐ 실무 권장 Naming 규칙 (Slicer)

MONAI segmentation 정리 후:

01_Frontal
02_Temporal
03_Parietal
04_Cingulate
05_Precuneus
06_PostCingulate
99_WholeCerebellum

CSV / Excel 자동화할 때 매우 중요합니다.

⚠️ 중요한 차이점 3가지

① FreeSurfer는 gyral 기반

MONAI는:

👉 일부 sulcus 기반 merge

그래서:

  • parsopercularis 등은
    → Inferior Frontal 로 흡수

② MONAI는 white/gray 분리 없음

FreeSurfer:

ctx-lh-*

MONAI:

👉 cortex만 제공

③ MONAI는 aseg 일부 생략

예:

  • ventraldc

  • vessel

없음 → PET SUVr에는 영향 없음

✅ PET SUVr 관점에서 “완벽 호환 전략”

FreeSurfer 스타일을 MONAI에서 재현하려면:

1️⃣ MONAI 기본 parcellation

2️⃣ Segment Editor → Logical Union

3️⃣ ADNI Composite 생성

4️⃣ Whole Cerebellum 생성

이렇게 하면:

👉 FreeSurfer aparc 기반 ADNI SUVr과
👉 MONAI 기반 SUVr

통계적으로 거의 동일 수준 도달합니다.

(논문 기준 ±2–3%)

✨ 요약

  • MONAI ≈ FreeSurfer DK atlas

  • 이름만 다름

  • Inferior frontal 계열 merge 주의

  • cerebellum 좌우 반드시 Union

  • ADNI Composite 직접 생성 필요

다음 단계:

✅ 자동 변환 Slicer Python (aparc → MONAI ROI)
✅ FreeSurfer CSV → MONAI CSV matching 스크립트
✅ 두 파이프라인 SUVr 비교 QC 방법
✅ 논문용 ROI 정의 표 템플릿

지금 수준이면 FreeSurfer 없이도 ADNI급 파이프라인 충분히 구축 가능합니다 👍

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