๐ง ๋๋ ์ ‘์์ ์ธ์’์ผ๊น?[ch] Brain Network & Graph Theory๋ก ๋ณด๋ ๋ ์ฐ๊ฒฐ์ฑ(Brain Connectivity) ์์ ์ ๋ณต
๐ง ๋๋ ์ ‘์์ ์ธ์’์ผ๊น?[ch]
Brain Network & Graph Theory๋ก ๋ณด๋ ๋ ์ฐ๊ฒฐ์ฑ(Brain Connectivity) ์์ ์ ๋ณต
๐ ๊ฒ์ ์ค๋ช (150์ ์ด๋ด)
๋ ๋คํธ์ํฌ๋ ์ ‘6๋จ๊ณ ๋ฒ์น’์ ๋ฎ์์๊น? ๊ทธ๋ํ ์ด๋ก ์ผ๋ก ํจ์จ·๋น์ฉ·4๋ ์งํ๋ฅผ ํ ๋ฒ์ ์ดํด! ๋ณต์กํ fMRI ๋ถ์, ์ง๊ธ ํด๊ฒฐํ์ธ์.
๐ ๋ชฉ์ฐจ
์ ๋ ๋คํธ์ํฌ ๋ถ์(Brain Network Analysis) ์ธ๊ฐ?
๊ทธ๋ํ ์ด๋ก (Graph Theory)์ ๊ธฐ๋ณธ ๊ตฌ์กฐ
์ ๊ท ๋คํธ์ํฌ vs ๋๋ค ๋คํธ์ํฌ
Small-World ๊ตฌ์กฐ๋ ๋ฌด์์ธ๊ฐ?
๋ ๋คํธ์ํฌ ๊ตฌ์ฑ ์ ์ฐจ (์คํ ๋งค๋ด์ผ)
๋คํธ์ํฌ 4๋ ํต์ฌ ์งํ ์์ ์ดํด
์ง๋ณ ์ฐ๊ตฌ์์ ๋คํธ์ํฌ ๋ถ์์ด ์ค์ํ ์ด์
ํ์ ์ฐธ๊ณ ๋ ผ๋ฌธ ๋ฐ ๋๊ตฌ
[์ถ๊ฐ ์ค๋ช ] ์ค์ ์ฐ๊ตฌ ์ค๊ณ ํ
ํต์ฌ ์์ฝ
ํ๊ทธ
1️⃣ ์ ๋ ๋คํธ์ํฌ ๋ถ์์ธ๊ฐ?
๊ธฐ์กด์ ๋ ํ์ฑํ(Brain Activation) ๋ถ์์
“์ด๋๊ฐ ์ผ์ก๋๊ฐ?”์ ์ง์คํฉ๋๋ค.
ํ์ง๋ง ๋คํธ์ํฌ ๋ถ์์ ๋ฌป์ต๋๋ค.
“์ด ์์ญ์ ๋๊ตฌ์ ์ฐ๊ฒฐ๋์ด ์๋๊ฐ?”
“์ด ์ฐ๊ฒฐ์ด ๋์ด์ง๋ฉด ์ ์ฒด ์์คํ ์ ์ด๋ป๊ฒ ๋ณํ๋๊ฐ?”
์ด ์ฐจ์ด๊ฐ ์ฐ๊ตฌ์ ์ฐจ์์ ๋ฐ๊ฟ๋๋ค.
ํนํ fMRI, EEG, DTI ์๋์์๋
์ฐ๊ฒฐ์ฑ(Connectivity) ์ด ํต์ฌ์
๋๋ค.
2️⃣ ๊ทธ๋ํ ์ด๋ก (Graph Theory)์ ๊ธฐ๋ณธ ๊ตฌ์กฐ
๊ทธ๋ํ ์ด๋ก ์ ๋คํธ์ํฌ๋ฅผ ์ํ์ ์ผ๋ก ํํํ๋ ๋ฐฉ๋ฒ์ ๋๋ค.
๊ธฐ๋ณธ ๊ตฌ์ฑ
๋ ธ๋(Node) = ๋ ์์ญ (Brain Region)
์ฃ์ง(Edge) = ์ฐ๊ฒฐ(Connection)
์ฆ,
๋ = ์ ๋ค์ ์งํฉ + ์ ์ ์๋ ์
๐ ์์ ๊ตฌ์กฐ
●——●——●
| |
●——●——●
์ = ๋
ธ๋
์ = ์ฃ์ง
3️⃣ ์ ๊ท ๋คํธ์ํฌ vs ๋๋ค ๋คํธ์ํฌ
① ์ ๊ท ๋คํธ์ํฌ (Regular Network)
์ด์๋ผ๋ฆฌ๋ง ์ฐ๊ฒฐ
๋น์ฉ(Wiring Cost) ๋ฎ์
ํจ์จ(Efficiency) ๋ฎ์
② ๋๋ค ๋คํธ์ํฌ (Random Network)
์ฅ๊ฑฐ๋ฆฌ ์ฐ๊ฒฐ ์กด์ฌ
ํจ์จ ๋์
๋น์ฉ ๋งค์ฐ ๋์
๐ก ํต์ฌ ๊ฐ๋
๋๋ ๋ ๊ตฌ์กฐ์ ์ค๊ฐ ํํ์ ๋๋ค.
4️⃣ Small-World ๊ตฌ์กฐ๋?
Small-World Network๋
๋์ ์ง์ญ ์์ง๋(Clustering) + ์งง์ ํ๊ท ๊ฒฝ๋ก ๊ธธ์ด(Path Length)
๋ฅผ ๋์์ ๋ง์กฑํ๋ ๊ตฌ์กฐ์ ๋๋ค.
์ด ๊ฐ๋ ์ 6๋จ๊ณ ๋ถ๋ฆฌ ์ด๋ก (Six Degrees of Separation)์์ ์ ๋ํ์ต๋๋ค.
๐ ์ง๊ด์ ๊ทธ๋ฆผ
[๋ชจ๋ A] ——(์ฅ๊ฑฐ๋ฆฌ ์ฐ๊ฒฐ)—— [๋ชจ๋ B]
๋ชจ๋ ๋ด๋ถ๋ ์ด์ด
๋ชจ๋ ๊ฐ์ ์ ํ์ ์ฐ๊ฒฐ
์ด๊ฒ์ด ๋์ ๊ตฌ์กฐ์ ๋๋ค.
5️⃣ ๐ ๋ ๋คํธ์ํฌ ๊ตฌ์ฑ ์ ์ฐจ (์ค์ ๋งค๋ด์ผ)
๋ค์์ fMRI ๊ธฐ๋ฐ ๋คํธ์ํฌ ๋ถ์ ์ ์ฐจ์ ๋๋ค.
✅ STEP 1. ๋ฐ์ดํฐ ํ๋ณด
Resting-state fMRI
์ฝ 200 Time Points ์ด์ ๊ถ์ฅ
✅ STEP 2. ROI ์ค์ (๋ ธ๋ ์ ์)
AAL atlas
Brainnetome atlas
๋๋ ์ฌ์ฉ์ ์ ์ ROI
✅ STEP 3. ์๊ด๊ณ์ ๊ณ์ฐ
Pearson Correlation
๊ฒฐ๊ณผ → Connectivity Matrix
✅ STEP 4. Threshold ์ ์ฉ
๋ณดํต r > 0.3 ์ฌ์ฉ
(์ ์์์ค ์ฝ p < 0.05 ์์ค)
๐ฒ ์คํ ๊ฐ๋ฅ ์์ญ 1
[์ถ์ฒ ๋ฐฉ๋ฒ]
Threshold๋ฅผ ํ๋๋ง ์ฐ์ง ๋ง๊ณ
0.1 ~ 0.4 ๋ฒ์๋ฅผ ์ฌ๋ฌ ๋จ๊ณ๋ก ์ ์ฉ ํ
๋คํธ์ํฌ ๋ณํ ์ถ์
→ ์ฐ๊ตฌ ๋ ผ๋ฌธ์์ ์ ๋ขฐ๋ ์์น
✅ STEP 5. ๊ฐ์ค ๋คํธ์ํฌ vs ์ด์ง ๋คํธ์ํฌ ์ ํ
Weighted Network → ๊ฐ๋ ์ ์ง
Binary Network → 0 ๋๋ 1
6️⃣ ๋คํธ์ํฌ 4๋ ํต์ฌ ์งํ
1. Degree (์ฐจ์)
์ฐ๊ฒฐ๋ ๋ ธ๋ ๊ฐ์
์:
๋
ธ๋ 9๊ฐ 4๊ฐ์ ์ฐ๊ฒฐ → Degree = 4
2. Strength (๊ฐ๋)
์ฐ๊ฒฐ ๊ฐ๋์ ํ๊ท
3. Clustering Coefficient (๊ตฐ์ง ๊ณ์)
์ด์๋ผ๋ฆฌ ์ผ๋ง๋ ์ฐ๊ฒฐ๋์ด ์๋๊ฐ?
๊ฐ์ด 1์ ๊ฐ๊น์ธ์๋ก ์์ง๋ ๋์
4. Shortest Path Length (์ต๋จ ๊ฒฝ๋ก ๊ธธ์ด)
A์์ B๊น์ง ๊ฐ๋ ์ต์ ๋จ๊ณ ์
์งง์์๋ก ํจ์จ ↑
๐ ํจ์จ ๊ณต์ ์ง๊ด
ํจ์จ ≈ 1 / ๊ฒฝ๋ก ๊ธธ์ด
7️⃣ ์ง๋ณ ์ฐ๊ตฌ์์ ์ ์ค์ํ๊ฐ?
์๋ฅผ ๋ค์ด:
์ฐ๊ฒฐ 3–4 ํ๊ดด → ์ํฅ ์ ํ์
์ฐ๊ฒฐ 3–9 ํ๊ดด → ์ ์ฒด ๋คํธ์ํฌ ๋ถ๊ดด ๊ฐ๋ฅ
์?
9๋ฒ ๋ ธ๋๊ฐ ํ๋ธ(Hub)์ผ ๊ฐ๋ฅ์ฑ ๋๋ฌธ
๐ ๋คํธ์ํฌ ๋ถ์์ด ํ์ํ ์ด์
์ง๋ณ์
๋จ์ผ ์์ญ์ด ์๋๋ผ
๋คํธ์ํฌ๋ฅผ ๋ถ๊ดด์ํจ๋ค
8️⃣ ํ์ ์ฐธ๊ณ ๋ ผ๋ฌธ
๐ Brain Connectivity Toolbox ๋ ผ๋ฌธ
Rubinov & Sporns (2010)
NeuroImage
5000ํ ์ด์ ์ธ์ฉ
์ด ๋ ผ๋ฌธ์ ๋คํธ์ํฌ ์งํ ๊ณ์ฐ์ ํ์ค์ ๋๋ค.
์ฐธ๊ณ ์ฌ์ดํธ
Brain Connectivity Toolbox
https://sites.google.com/site/bctnet/GRETNA Toolbox
http://www.nitrc.org/projects/gretna/BrainNet Viewer
https://www.nitrc.org/projects/bnv/
9️⃣ [์ถ๊ฐ ์ค๋ช ] ์ค์ ์ฐ๊ตฌ ์ค๊ณ ํ
(์์์๋ ์์ง๋ง ์ค์ ์ฐ๊ตฌ์์ ์ค์)
๐ฒ ์คํ ๊ฐ๋ฅ ์์ญ 2
[์ต์ ํธ๋ ๋]
Small-worldness ์งํ
Modularity ๋ถ์
Hub ๋ถ์
Rich-club coefficient
ํนํ Alzheimer ์ฐ๊ตฌ์์
Hub ๋ถ๊ดด๊ฐ ์ฃผ์ ํจํด
๐ฒ ์คํ ๊ฐ๋ฅ ์์ญ 3
๋จธ์ ๋ฌ๋๊ณผ ๊ฒฐํฉ
๋คํธ์ํฌ ์งํ → Feature๋ก ์ฌ์ฉ
→ ์ง๋ณ ๋ถ๋ฅ ๋ชจ๋ธ ๊ตฌ์ถ
๐ผ ์ดํด๋ฅผ ๋๋ ๊ทธ๋ฆผ
1️⃣ ์ ๊ท vs ๋๋ค vs Small-world
์ ๊ท: ●—●—●—●
๋๋ค: ●———●
\ /
●
Small: ●—●—●
\ /
●——●
2️⃣ ํ๋ธ ๋ ธ๋ ์์
●
|
●———●———●
|
●
์ค์ ๋ ธ๋ ์ ๊ฑฐ ์ ์ ์ฒด ๋ถ๊ดด
๐ฅ ์ฌ๋ฏธ์๋ ์ธ์ฉ
“์ฐ๋ฆฌ๋ ๊ฑฐ๋ํ ์ธ์์ ์ด๊ณ ์์ง๋ง, ์ฌ์ค์ ์์ฃผ ์์ ์ธ์ ์์ ์๋ค.”¹
¹ Six Degrees of Separation ๊ฐ๋ ์ค๋ช
๐ฏ ํต์ฌ ์์ฝ
๋๋ Small-World Network
๋น์ฉ์ ๋ฎ๊ณ ํจ์จ์ ๋๋ค
๋คํธ์ํฌ = ๋ ธ๋ + ์ฃ์ง
4๋ ์งํ:
Degree
Strength
Clustering
Path Length
์ง๋ณ ์ฐ๊ตฌ์ ํ์์ ๋ถ์ ๋ฐฉ๋ฒ
๐ ํ๊ทธ
๋๋คํธ์ํฌ, BrainNetwork, ๊ทธ๋ํ์ด๋ก , GraphTheory, SmallWorld, fMRI, FunctionalConnectivity, NeuroImage, BrainConnectivityToolbox
ํ์
✔ ์ค์ ๋ถ์ ์ค์ต ๋งค๋ด์ผ ๋ฒ์
✔ ๊ฐ์์ฉ PPT ๊ตฌ์ฑ์
✔ ์ฐ๊ตฌ ๋
ผ๋ฌธ ์์ฑ ํ
ํ๋ฆฟ
๋๊ธ
๋๊ธ ์ฐ๊ธฐ