๐Ÿง  ๋‡Œ์˜ '๊ธธ'์„ ์ฐพ๋Š” ์ƒˆ๋กœ์šด ๋ฐฉ๋ฒ•: T2R ์ปค๋„ฅํ†ฐ(Connectome) ๊ฐ€์ด๋“œ

 

๐Ÿง  ๋‡Œ์˜ '๊ธธ'์„ ์ฐพ๋Š” ์ƒˆ๋กœ์šด ๋ฐฉ๋ฒ•: T2R ์ปค๋„ฅํ†ฐ(Connectome) ๊ฐ€์ด๋“œ

ํ˜„๋Œ€ ๋‡Œ๊ณผํ•™์˜ ํŒ๋„๋ฅผ ๋ฐ”๊พธ๊ณ  ์žˆ๋Š” ๋‡Œ ์ง€๋„ ์ œ์ž‘์˜ ์‹ ๊ธฐ์ˆ , ๋ฐ”๋กœ **ํŠธ๋ž™-์˜์—ญ ์ปค๋„ฅํ†ฐ(Tract-to-Region Connectome, ์ดํ•˜ T2R)**์— ๋Œ€ํ•ด ์™„๋ฒฝํ•˜๊ฒŒ ์ •๋ฆฌํ•ด ๋“œ๋ฆฌ๊ฒ ์Šต๋‹ˆ๋‹ค.

๊ธฐ์กด์˜ ๋ฐฉ์‹์ด '๋„์‹œ์™€ ๋„์‹œ ์‚ฌ์ด์˜ ๊ฑฐ๋ฆฌ'๋งŒ ์ธก์ •ํ–ˆ๋‹ค๋ฉด, ์ด ์ƒˆ๋กœ์šด ๋ฐฉ์‹์€ **'ํŠน์ • ๊ณ ์†๋„๋กœ๊ฐ€ ์–ด๋А ๋„์‹œ๋“ค์„ ํ†ต๊ณผํ•˜๋Š”์ง€'**๋ฅผ ๋” ์ •ํ™•ํ•˜๊ฒŒ ๋ณด์—ฌ์ค๋‹ˆ๋‹ค. ๋‡Œ ๋ถ„์„์˜ ๊ณ ์ˆ˜๊ฐ€ ๋˜๊ณ  ์‹ถ๋‹ค๋ฉด ์ด ์ ˆ์ฐจ๋ฅผ ๋ฐ˜๋“œ์‹œ ์ตํ˜€๋ณด์„ธ์š”!


๐Ÿ“‘ ๋ชฉ์ฐจ

  1. ์ปค๋„ฅํ†ฐ์˜ ๊ธฐ์ดˆ: ์˜์—ญ-์˜์—ญ vs ํŠธ๋ž™-์˜์—ญ

  2. ๊ธฐ์กด ๋ฐฉ์‹์˜ ์น˜๋ช…์  ๊ฒฐํ•จ: '๊ต์ฐจ์™€ ์ž…๋งž์ถค' ๋ฌธ์ œ

  3. T2R์˜ ํ˜์‹ : ์™œ ์ด ๋ฐฉ์‹์ด ๋” ์ •ํ™•ํ•œ๊ฐ€?

  4. DSI Studio๋ฅผ ํ™œ์šฉํ•œ ์‹ค์ „ ๋ถ„์„ ์ ˆ์ฐจ (์‹คํ–‰ ๊ฐ€๋Šฅ ์˜์—ญ)

  5. ์ „๋ฌธ๊ฐ€ ํŒ: ๊ฒฐ๊ณผ ์‹œ๊ฐํ™” ๋ฐ ๋ฐ์ดํ„ฐ ์ถ”์ถœ๋ฒ•

  6. ์š”์•ฝ ๋ฐ ํ•ต์‹ฌ ์ •๋ฆฌ


1. ๐Ÿ” ์ปค๋„ฅํ†ฐ์˜ ๊ธฐ์ดˆ: ๋ฌด์—‡์ด ๋‹ค๋ฅธ๊ฐ€?

**์ปค๋„ฅํ†ฐ(Connectome/๋‡Œ ์—ฐ๊ฒฐ ์ง€๋„)**์€ ๋‡Œ์˜ ์„œ๋กœ ๋‹ค๋ฅธ ์˜์—ญ๋“ค์ด ์–ด๋–ป๊ฒŒ ์†Œํ†ตํ•˜๋Š”์ง€๋ฅผ ๋‚˜ํƒ€๋‚ธ ์ง€๋„์ž…๋‹ˆ๋‹ค.

  • ์˜์—ญ-์˜์—ญ ์ปค๋„ฅํ†ฐ (Region-to-Region): ์ „ํ†ต์ ์ธ ๋ฐฉ์‹์ž…๋‹ˆ๋‹ค. ๋ฐ”๋‘‘ํŒ ๊ฐ™์€ ์ •๋ฐฉ ํ–‰๋ ฌ(Square Matrix)์„ ์‚ฌ์šฉํ•˜์—ฌ 'A ์˜์—ญ๊ณผ B ์˜์—ญ์ด ์—ฐ๊ฒฐ๋˜์—ˆ๋Š”๊ฐ€?'๋ฅผ ์ธก์ •ํ•ฉ๋‹ˆ๋‹ค.

  • ํŠธ๋ž™-์˜์—ญ ์ปค๋„ฅํ†ฐ (Tract-to-Region): ์ƒˆ๋กœ์šด ๋ฐฉ์‹์ž…๋‹ˆ๋‹ค. ์„ธ๋กœ์ถ•์—๋Š” ๋‡Œ ์˜์—ญ, ๊ฐ€๋กœ์ถ•์—๋Š” **๋ฐฑ์งˆ ํŠธ๋ž™(White Matter Tract/์‹ ๊ฒฝ ๋‹ค๋ฐœ)**์„ ๋‘ก๋‹ˆ๋‹ค. ํŠน์ • ์‹ ๊ฒฝ ๋‹ค๋ฐœ์ด ๊ฐ ์˜์—ญ๊ณผ ์–ผ๋งˆ๋‚˜ ๊ฐ•๋ ฅํ•˜๊ฒŒ ์—ฐ๊ฒฐ๋˜๋Š”์ง€๋ฅผ ๋งตํ•‘ํ•ฉ๋‹ˆ๋‹ค.


2. ⚠️ ๊ธฐ์กด ๋ฐฉ์‹์˜ ์น˜๋ช…์  ๊ฒฐํ•จ: '๊ต์ฐจ์™€ ์ž…๋งž์ถค' ๋ฌธ์ œ

์™œ ๊ธฐ์กด ๋ฐฉ์‹์„ ์ถ”์ฒœํ•˜์ง€ ์•Š์„๊นŒ์š”? 2017๋…„์˜ ์œ ๋ช…ํ•œ ์—ฐ๊ตฌ¹์— ๋”ฐ๋ฅด๋ฉด **์„ฌ์œ  ์ถ”์ ๋ฒ•(Tractography)**์—๋Š” ํ•œ๊ณ„๊ฐ€ ์žˆ๊ธฐ ๋•Œ๋ฌธ์ž…๋‹ˆ๋‹ค.

"์‹ ๊ฒฝ ๋‹ค๋ฐœ์ด ์„œ๋กœ ๊ต์ฐจํ•˜๊ฑฐ๋‚˜(Crossing) ์‚ด์ง ์Šค์ณ ์ง€๋‚˜๊ฐˆ ๋•Œ(Kissing), ๊ธฐ์กด ๋ฐฉ์‹์€ ์ด๋ฅผ ๊ตฌ๋ณ„ํ•˜์ง€ ๋ชปํ•ด ์ž˜๋ชป๋œ ์—ฐ๊ฒฐ ์ •๋ณด๋ฅผ ์ƒ์„ฑํ•ฉ๋‹ˆ๋‹ค."

  • ISMRM Tractography Challenge (2017)¹

  • ๊ต์ฐจ(Crossing): ๋‘ ๋„๋กœ๊ฐ€ ์ž…์ฒด ๊ต์ฐจ๋กœ์ฒ˜๋Ÿผ ์—‡๊ฐˆ๋ฆฌ๋Š” ํ˜„์ƒ.

  • ์ž…๋งž์ถค(Kissing): ๋‘ ๋„๋กœ๊ฐ€ ๋‚˜๋ž€ํžˆ ๊ฐ€๋‹ค๊ฐ€ ๋‹ค์‹œ ๊ฐˆ๋ผ์ง€๋Š” ํ˜„์ƒ.

    ๊ธฐ์กด ๋ฐฉ์‹์œผ๋กœ๋Š” ์ด ๋น„์œจ์„ ์ •ํ™•ํžˆ ๊ณ„์‚ฐํ•˜๋Š” ๊ฒƒ์ด **๊ฑฐ์˜ ๋ถˆ๊ฐ€๋Šฅ(Almost impossible)**ํ•ฉ๋‹ˆ๋‹ค.


3. ✨ T2R์˜ ํ˜์‹ : ์ƒˆ๋กœ์šด ๊ด€์ 

T2R ๋ฐฉ์‹์€ ์ด ๊ณจ์น˜ ์•„ํ”ˆ ๋ฌธ์ œ๋ฅผ **์šฐํšŒ(Bypass)**ํ•ฉ๋‹ˆ๋‹ค. ํŠน์ • ํŠธ๋ž™(์˜ˆ: ๊ถ์ƒ์†) ์ „์ฒด๋ฅผ ํ•˜๋‚˜์˜ ๊ฐœ์ฒด๋กœ ๋ณด๊ณ , ์ด ํŠธ๋ž™์ด ๊ฐ ์˜์—ญ(์˜ˆ: ๋ธŒ๋กœ์นด ์˜์—ญ, ๋ฒ ๋ฅด๋‹ˆ์ผ€ ์˜์—ญ)๊ณผ ์—ฐ๊ฒฐ๋œ ์ •๋„๋งŒ ์ธก์ •ํ•˜๊ธฐ ๋•Œ๋ฌธ์ž…๋‹ˆ๋‹ค. ํ›จ์”ฌ ๋” ์ง๊ด€์ ์ด๊ณ  ์˜ค๋ฅ˜๊ฐ€ ์ ์Šต๋‹ˆ๋‹ค.


4. ๐Ÿš€ [์‹ค์ „ ์ ˆ์ฐจ] DSI Studio๋กœ T2R ์ปค๋„ฅํ†ฐ ๋งŒ๋“ค๊ธฐ

์ด ์„น์…˜์€ ์—ฌ๋Ÿฌ๋ถ„์˜ ๊ฐ•์˜์—์„œ ์ˆ˜๊ฐ•์ƒ๋“ค์ด ์ง์ ‘ ๋”ฐ๋ผ ํ•  ์ˆ˜ ์žˆ๋Š” ๊ฐ€์ด๋“œ์ž…๋‹ˆ๋‹ค.

[ ๐Ÿ’ป T2R ์ปค๋„ฅํ†ฐ ๋ถ„์„ 3๋‹จ๊ณ„ ์‹คํ–‰ ๊ฐ€์ด๋“œ ]

1๋‹จ๊ณ„: ์‹ ๊ฒฝ ํŠธ๋ž™(Tract) ์ •์˜ํ•˜๊ธฐ

  • DSI Studio๋ฅผ ์‹คํ–‰ํ•˜๊ณ  Automatic Fiber Tracking ๊ธฐ๋Šฅ์„ ์‚ฌ์šฉํ•ฉ๋‹ˆ๋‹ค.

  • ์—ฐํ•ฉ ๊ฒฝ๋กœ(Association pathway) ์ค‘ **๊ถ์ƒ์†(Arcuate Fasciculus)**์ด๋‚˜ ๋Œ€์ƒ์†(Cingulum) ๊ฐ™์€ ์ฃผ์š” ํŠธ๋ž™์„ ๋จผ์ € ์„ค์ •ํ•˜์„ธ์š”. ์ด ํŠธ๋ž™๋“ค์€ ๊ฐœ์ธ๋ณ„ ์ฐจ์ด๊ฐ€ ์ปค์„œ ์—ฐ๊ตฌ ๊ฐ€์น˜๊ฐ€ ๋†’์Šต๋‹ˆ๋‹ค.

2๋‹จ๊ณ„: ๋‡Œ ์˜์—ญ(Atlas) ์„ค์ •ํ•˜๊ธฐ

  • ํŠธ๋ž™์ด ์–ด๋А ์˜์—ญ์„ ์ง€๋‚˜๋Š”์ง€ ์ •์˜ํ•ด์•ผ ํ•ฉ๋‹ˆ๋‹ค.

  • HCP-MMP ๋˜๋Š” ์ „ํ†ต์ ์ธ ๋ธŒ๋กœ๋“œ๋งŒ ์˜์—ญ(Brodmann Areas) ์•„ํ‹€๋ผ์Šค๋ฅผ ๋กœ๋“œํ•˜์—ฌ ๋‡Œ์˜ ๊ตฌํš์„ ๋‚˜๋ˆ•๋‹ˆ๋‹ค.

3๋‹จ๊ณ„: T2R ์ปค๋„ฅํ†ฐ ๋งคํŠธ๋ฆญ์Šค ์ƒ์„ฑ

  • Region ๋ฉ”๋‰ด์—์„œ Tract to Region Connectome ๊ธฐ๋Šฅ์„ ์‹คํ–‰ํ•ฉ๋‹ˆ๋‹ค.

  • ๊ฒฐ๊ณผ๊ฐ’(0~1 ์‚ฌ์ด)์„ ๋ณต์‚ฌํ•˜์—ฌ Excel์— ๋ถ™์—ฌ๋„ฃ์œผ์„ธ์š”. 0.02๋ผ๋Š” ๊ฐ’์€ ํ•ด๋‹น ์˜์—ญ ๋ถ€ํ”ผ์˜ 2%๊ฐ€ ๊ทธ ํŠธ๋ž™๊ณผ ์—ฐ๊ฒฐ๋˜์–ด ์žˆ์Œ์„ ์˜๋ฏธํ•ฉ๋‹ˆ๋‹ค.



5. ๐ŸŽจ ์ „๋ฌธ๊ฐ€์˜ ์‹œ๊ฐํ™” ๋ฐ ๋ฐ์ดํ„ฐ ์ถ”์ถœ

๋ถ„์„์ด ๋๋‚ฌ๋‹ค๋ฉด ๋ˆˆ์œผ๋กœ ํ™•์ธํ•ด์•ผ๊ฒ ์ฃ ?

  • Matrix ์‹œ๊ฐํ™”: Region rendering ์˜ต์…˜์—์„œ ์ƒ‰์ƒ ๊ธฐ์ค€์„ Matrix๋กœ ๋ฐ”๊พธ๋ฉด, ํŠน์ • ํŠธ๋ž™๊ณผ ๊ฐ•๋ ฅํ•˜๊ฒŒ ์—ฐ๊ฒฐ๋œ ๋ถ€์œ„๊ฐ€ ๋œจ๊ฑฐ์šด ์ƒ‰(Hot color)์œผ๋กœ ํ‘œ์‹œ๋ฉ๋‹ˆ๋‹ค.

  • ๋ช…๋ น์–ด ์‚ฌ์šฉ: ๋Œ€๋Ÿ‰์˜ ๋ฐ์ดํ„ฐ๋ฅผ ๋ถ„์„ํ•  ๋•Œ๋Š” ์›น์‚ฌ์ดํŠธ์˜ DSI Studio Documentation์„ ์ฐธ์กฐํ•˜์—ฌ ์ปค๋งจ๋“œ๋ผ์ธ(Command line) ๋ช…๋ น์–ด๋ฅผ ํ™œ์šฉํ•˜์„ธ์š”.


๐Ÿ’ก ๊ฐ•์˜๋ฅผ ์œ„ํ•œ ์ถ”๊ฐ€ ์„ค๋ช… (Labeling: ์ถ”๊ฐ€ ์ •๋ณด)

[์ถ”๊ฐ€ ์ •๋ณด: ๋ฐฑ์งˆ ํŠธ๋ž™์˜ ์ค‘์š”์„ฑ]

๋‡Œ์˜ ๊ธฐ๋Šฅ์  ๋ณ€ํ™”๋‚˜ ์งˆ๋ณ‘ ์ƒํƒœ๋ฅผ ์ดํ•ดํ•  ๋•Œ, ๋‡Œ ์˜์—ญ ๊ทธ ์ž์ฒด๋ณด๋‹ค ์˜์—ญ๋“ค์„ ์ด์–ด์ฃผ๋Š” **๋ฐฑ์งˆ ํŠธ๋ž™(White Matter Tracks)**์˜ ์ƒํƒœ๊ฐ€ ๋” ์ค‘์š”ํ•œ ์ •๋ณด๊ฐ€ ๋˜๋Š” ๊ฒฝ์šฐ๊ฐ€ ๋งŽ์Šต๋‹ˆ๋‹ค. T2R์€ ์ด ํŠธ๋ž™์˜ ๊ฑด๊ฐ• ์ƒํƒœ๋ฅผ ์ˆ˜์น˜ํ™”ํ•˜๋Š” ๊ฐ€์žฅ ์ง„๋ณด๋œ ๋ฐฉ๋ฒ•์ž…๋‹ˆ๋‹ค. [์ถ”๊ฐ€๋จ]

[์ฐธ๊ณ ๋ฌธํ—Œ]

  1. Maier-Hein, K. H., et al. (2017). "The challenge of mapping the human connectome based on diffusion tractography." Nature Communications. (๊ธฐ์กด ๋ฐฉ์‹์˜ ํ•œ๊ณ„๋ฅผ ์ง€์ ํ•œ ํ•ต์‹ฌ ๋…ผ๋ฌธ) [์ถ”๊ฐ€๋จ]

  2. DSI Studio Online Documentation: Tract Analysis ์„น์…˜. [์ถ”๊ฐ€๋จ]


๐Ÿ“ ์š”์•ฝ: ์ด๊ฒƒ๋งŒ์€ ๊ธฐ์–ตํ•˜์„ธ์š”!

  1. ์ „ํ†ต์  ๋ฐฉ์‹์˜ ํ•œ๊ณ„: ์„ฌ์œ ์˜ ๊ต์ฐจ/์ž…๋งž์ถค ๋ฌธ์ œ๋กœ ์—ฐ๊ฒฐ ๊ฐ•๋„๊ฐ€ ๋ถ€์ •ํ™•ํ•  ์ˆ˜ ์žˆ์Œ.

  2. T2R์˜ ์žฅ์ : ํŠธ๋ž™ ์ „์ฒด๋ฅผ ํ•˜๋‚˜์˜ ๋‹จ์œ„๋กœ ๋ถ„์„ํ•˜์—ฌ ๋ณต์žกํ•œ ํ•ด๋ถ€ํ•™์  ์˜ค๋ฅ˜๋ฅผ ์šฐํšŒํ•จ.

  3. ํ•ต์‹ฌ ๋„๊ตฌ: DSI Studio๋ฅผ ์‚ฌ์šฉํ•ด ์ž๋™ ํŠธ๋ž˜ํ‚น๊ณผ ์•„ํ‹€๋ผ์Šค ๋งคํ•‘์„ ๊ฒฐํ•ฉํ•จ.

  4. ๋ฐ์ดํ„ฐ ํ™œ์šฉ: ์—‘์…€๋กœ ์ถ”์ถœ๋œ '๋ถ€ํ”ผ ๋น„์œจ' ๋ฐ์ดํ„ฐ๋ฅผ ํ†ตํ•ด ๊ฐœ์ธ๋ณ„ ๋‡Œ ์ง€๋„๋ฅผ ์ •๋ฐ€ํ•˜๊ฒŒ ๋น„๊ต ๊ฐ€๋Šฅ.


ํƒœ๊ทธ: #๋‡Œ๊ณผํ•™ #์ปค๋„ฅํ†ฐ #DSIStudio #๋‡Œ์ง€๋„ #T2R #์‹ ๊ฒฝ๊ณผํ•™ #๋ฐ์ดํ„ฐ๋ถ„์„ #๋ฐฑ์งˆํŠธ๋ž™ #์ปค๋„ฅํ†ฐ๊ฐ•์˜ #๋‡Œํ•ด๋ถ€ํ•™

[Blogger/Blogspot ๊ฒ€์ƒ‰ ์„ค๋ช…]

์ „ํ†ต์ ์ธ ๋‡Œ ์—ฐ๊ฒฐ ๋ฐฉ์‹์˜ ์น˜๋ช…์  ๊ฒฐํ•จ(๊ต์ฐจ ์˜ค๋ฅ˜)์„ ํ•ด๊ฒฐํ•  3๋‹จ๊ณ„ T2R ์ปค๋„ฅํ†ฐ ๋ถ„์„ ๊ฐ€์ด๋“œ! DSI Studio๋ฅผ ํ™œ์šฉํ•œ ์ •ํ™•ํ•œ ๋‡Œ ์ง€๋„ ์ œ์ž‘๋ฒ•์œผ๋กœ ์—ฐ๊ตฌ์˜ ์งˆ์„ 2๋ฐฐ ๋†’์ด์„ธ์š”. (142์ž)


"์šฐ๋ฆฌ๋Š” ํŠธ๋ž™์ด ์–ด๋–ป๊ฒŒ ๊ผฌ์—ฌ ์žˆ๋Š”์ง€ ๋ชจ๋ฅด์ง€๋งŒ, ์ „์ฒด ํŠธ๋ž™์ด ์–ด๋””์— ๋‹ฟ๋Š”์ง€๋Š” ์•Œ ์ˆ˜ ์žˆ์Šต๋‹ˆ๋‹ค. ์ด๊ฒƒ์ด T2R์ด ์ฃผ๋Š” ํ†ต์ฐฐ์ž…๋‹ˆ๋‹ค."²

² ์ฃผ์„: ์˜์ƒ ์† ๊ฐ•์˜์ž๊ฐ€ T2R์˜ ์ฒ ํ•™์„ ์„ค๋ช…ํ•˜๋ฉฐ ๊ฐ•์กฐํ•œ ๋‚ด์šฉ์ž…๋‹ˆ๋‹ค.

๋Œ“๊ธ€

์ด ๋ธ”๋กœ๊ทธ์˜ ์ธ๊ธฐ ๊ฒŒ์‹œ๋ฌผ

ํžˆ๋ธŒ๋ฆฌ์ธ, ์ด์Šค๋ผ์—˜์ธ, ์œ ๋Œ€์ธ ์„ฑ๊ฒฝ ์† ์ด๋ฆ„์— ์ˆจ๊ฒจ์ง„ ์†Œ๋ฆ„ ๋‹๋Š” ๋น„๋ฐ€

์ž‘์€ ํ‹ˆ์ด ๋ฌด๋„ˆ๋œจ๋ฆฐ๋‹ค ์™œ ์šฐ๋ฆฌ๋Š” ‘์‚ฌ์†Œํ•œ ๋ถ„์—ด’์„ ๊ทน๋„๋กœ ๊ฒฝ๊ณ„ํ•ด์•ผ ํ•˜๋Š”๊ฐ€

์ž‘์€ ํ‹ˆ์ด ๋ฌด๋„ˆ๋œจ๋ฆฐ๋‹ค ์™œ ์„ฑ๊ฒฝ์€ ‘๋ถ„์—ด์˜ ์‹œ์ž‘’์„ ๊ทธ๋ ‡๊ฒŒ ๊ฒฝ๊ณ ํ•˜๋Š”๊ฐ€